使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

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请教一个问题，一个转录因子TF只会调控位于同一条链的基因，还是有可能调控反义链的基因？

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请问如何查询某基因的详细的Biological Function？

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请问一下，我的噬菌体基因组fasta文件还是config打头的，是不是需要进一步拼接成scaffold？还是挑选最大的config进行后续分析？

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已经有不同材料的全基因组二代测序数据，查找是否存在某个已知基因？

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知道一批基因的具体位置，如何批量的从基因组中取出基因序列？

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如何提取比对上某一个基因或者某一段序列的所有reads

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WGCNA筛选到感兴趣的模块后，如何找这个模块的hub基因呢？

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【求助】如何确定一种基因ID的类型

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批量获得基因间区及内含子的突变距离最近的基因外显子的距离

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问 链特异性文库（mRNA/lncRNA/circRNA）如何将RNA类型分开？

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问 无对照的转录组数据如何寻找差异表达基因

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问 log2(fold_change)可以用来做热图吗？遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为0时，怎么办？

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问 请问hisat2+stringtie+deseq2的标准流程

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问 ciriRNA表达量如何计算？（更）

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问 HISAT2建立索引

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问 聚类数据标准化

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问 用log2(fold_change)数据做热图，遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为inf或-inf时，怎么办？

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问 菌侵染植物的转录组分析中，若菌的一个基因在当前时间没有引起植物基因的变化，过了三个小时后才引起植物基因的变化，如何分析这种现象或如何将这一类基因关联起来，有没有类似的文献推荐？

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问 我测了一批寄生蜂的转录组样品，FPKM值感觉好奇怪，合理吗？

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