如果在基因组中鉴定到病毒序列，如何从生信角度判断它是EVEs还是HGTs

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可否用sanger测序测某一基因的上下游序列

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在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

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怎么对基因启动子含有什么元件进行分析

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为什么差异基因分析会出现被KO的基因log2FC的数值大于1的情况

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关于tophat2 + cufflinks 得到的差异基因和featureCounts差异基因数目相差太大原因

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转录本坐标转换成基因组坐标

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一般报告基因组某个碱基突变是指正链还是负链

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对突变组和对照组的某基因表达量做T检验

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知道一批基因的具体位置，如何批量的从基因组中取出基因序列？

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问 关于基因间的相关性分析

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问 annovar建立非模式物种注释库后怎么分析

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问 根据GFF和fasta等文件提取某一基因的ATG位点信息，比如具体的位置？

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问 想要提取指定基因的行信息

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问 在单细胞的细胞通讯分析软件cellphonedb的结果解读

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问 关于蛋白质文件的疑问

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问 在单细胞测序中，不同组的T细胞统计检验方法

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问 如何根据现有序列找到它们在三代基因组的编号

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问 smORF的鉴定方法

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问 生信问题（我也不知道该怎么问）

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