芯片数据去除批次效应一般用什么软件 如何操作？

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如何针对affy表达谱芯片计算结果分析不同样本之间是否表达差异

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GEOquery下载GEO数据软件报错

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GWAS 数据存储网站

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如何在差异表达前消除批次效应

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有关蛋白表达定量的数据库数据打包下载(蛋白组学)

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celseq2转换单细胞原始数据

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为什么单端测序的数据解压会出现多个文件？

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关于几个数据库对GO注释的疑问

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二代测序得到测序数据组装完成后如何进行丰度计算

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问 求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。

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问 关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件，为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别？

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问 请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？

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问 基因表达芯片的分类问题

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问 小麦660K芯片里，参考碱基那一列的A/C，哪个才是参考基因组的碱基？

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问 当LIMMA计算计算结果中的调整P值都大于0.05时，可否使用p值<0.05+fc>2来筛选差异表达基因？

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问 芯片数据去除批次效应一般用什么软件 如何操作？

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问 如何判断一篇CHIPseq的文章用的是hg19还是hg38

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问 Affy包中的MAplot函数的作用是什么？画出的MAplot图如何解读？为何要进行MAplot检查？

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问 使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

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