[求助]WGCNA具体参数

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【求助】差异表达和特异表达

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二代测序得到测序数据组装完成后如何进行丰度计算

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二代测序中计算有多少个count数才有研究意义?

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​单细胞RNA-seq，如何计算不同cluster之间的相关性

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求助服务器警报蜂鸣原因

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DoubletfFinder Pk值相关计算的问题

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求助GATK 说明书

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limma中的Removing heteroscedascity from count data和拟合线性模型是什么意思？

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FPKM计算问题

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问 请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？

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问 表达谱芯片的类型及每种类型能够测定的基因数量如何查询？有没有网站进行过总结？

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问 基因表达芯片的分类问题

2026 浏览 3 关注 2 回答 0 评论

问 芯片数据去除批次效应一般用什么软件 如何操作？

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问 安捷伦（Agilent）的数据处理软件Feature Extraction Software的默认的数据标准化的算法是什么？最后得到的值是否做了log2处理？是否是RMA或者MASS的一种？

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问 当LIMMA计算计算结果中的调整P值都大于0.05时，可否使用p值<0.05+fc>2来筛选差异表达基因？

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问 Affy包中的MAplot函数的作用是什么？画出的MAplot图如何解读？为何要进行MAplot检查？

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问 使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

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问 如何判断一篇CHIPseq的文章用的是hg19还是hg38

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问 芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

1688 浏览 2 关注 1 回答 0 评论