如何针对affy表达谱芯片计算结果分析不同样本之间是否表达差异

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linux 中less -S 如何查看过长被遮盖的内容

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ubuntu 14.04 server版安装软件 biocLite("highthroughputassays")，出现如下报错如何解决呢？

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如何根据Datamonkey中FUBAR的结果计算该基因的dn/ds值

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bivalent domains 如何计算

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HHblits使用相同的数据库，得出的结果明显差于HHpred网页版的结果。该如何使用HHsuite命令行得到与网页端类似的效果

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如何筛选小鼠lncRNA?

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生信到底如何入门？？？

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​单细胞RNA-seq，如何计算不同cluster之间的相关性

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请问无参转录组的GO分析如何进行

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问 安捷伦（Agilent）的数据处理软件Feature Extraction Software的默认的数据标准化的算法是什么？最后得到的值是否做了log2处理？是否是RMA或者MASS的一种？

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问 芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

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问 请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？

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问 基因表达芯片的分类问题

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问 Affy包中的MAplot函数的作用是什么？画出的MAplot图如何解读？为何要进行MAplot检查？

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问 在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

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问 表达谱芯片的类型及每种类型能够测定的基因数量如何查询？有没有网站进行过总结？

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问 小麦660K芯片里，参考碱基那一列的A/C，哪个才是参考基因组的碱基？

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问 当LIMMA计算计算结果中的调整P值都大于0.05时，可否使用p值<0.05+fc>2来筛选差异表达基因？

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问 关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件，为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别？

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