对于二代测序得到的测序数据组装完成后，可以通过以下步骤进行丰度计算：
1. 将组装好的序列与已知的基因组或转录组进行比对，得到每个序列在基因组或转录组中的位置信息。
2. 利用基因组或转录组注释信息对比对结果进行注释，确定每个序列所对应的基因或转录本。
3. 将比对到同一基因或转录本的序列进行合并，得到每个基因或转录本的总序列数。
4. 通过将每个基因或转录本的总序列数除以总测序量，计算出每个基因或转录本的丰度值。
5. 一般使用RPKM（Reads Per Kilobase per Million mapped reads）或TPM（Transcripts Per Million mapped reads）作为丰度值的单位，以消除样本间测序深度的差异。
需要注意的是，在进行丰度计算前，需要对测序数据进行质量控制和过滤，以去除低质量序列和污染序列的影响。此外，对于不同类型的样本，如微生物、植物、动物等，还需要选择不同的基因组或转录组进行比对和注释。
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