bowtie2 参考基因组注释 比对

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验证数据集基因名称

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已经有不同材料的全基因组二代测序数据，查找是否存在某个已知基因？

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蛋白表达矩阵

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单细胞seurat对象的基因过滤

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seurat包，如何调节大热图左侧的基因字体大小

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请教一个问题，一个转录因子TF只会调控位于同一条链的基因，还是有可能调控反义链的基因？

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IOBR包输入基因表达矩阵要求

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请问UCSC上下载的参考基因组中这个文件是什么含义

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enhancer结合ATAC-seq进行下游靶基因的寻找策略

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问 使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

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问 求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。

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问 小麦660K芯片里，参考碱基那一列的A/C，哪个才是参考基因组的碱基？

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问 安捷伦（Agilent）的数据处理软件Feature Extraction Software的默认的数据标准化的算法是什么？最后得到的值是否做了log2处理？是否是RMA或者MASS的一种？

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问 如何判断一篇CHIPseq的文章用的是hg19还是hg38

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问 芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

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问 关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件，为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别？

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问 请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？

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问 芯片数据去除批次效应一般用什么软件 如何操作？

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问 表达谱芯片的类型及每种类型能够测定的基因数量如何查询？有没有网站进行过总结？

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