如何提取比对上某一个基因或者某一段序列的所有reads

2165 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

想要提取指定基因的行信息

2031 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

基因组文件中chrUn具体是什么意思呢

1619 浏览 0 关注 0 回答 1 评论

请问一下，我的噬菌体基因组fasta文件还是config打头的，是不是需要进一步拼接成scaffold？还是挑选最大的config进行后续分析？

1947 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

ciriRNA表达量如何计算？

2772 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

【求助】如何确定一种基因ID的类型

3527 浏览 4 关注 2 回答 0 评论

对突变组和对照组的某基因表达量做T检验

1890 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

已经有不同材料的全基因组二代测序数据，查找是否存在某个已知基因？

2387 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

【求助】差异表达和特异表达

2559 浏览 3 关注 2 回答 0 评论

验证数据集基因名称

2075 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 安捷伦（Agilent）的数据处理软件Feature Extraction Software的默认的数据标准化的算法是什么？最后得到的值是否做了log2处理？是否是RMA或者MASS的一种？

1256 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

问 基因表达芯片的分类问题

2373 浏览 3 关注 2 回答 0 评论

问 在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

2093 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。

1875 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 如何判断一篇CHIPseq的文章用的是hg19还是hg38

2919 浏览 5 关注 3 回答 0 评论

问 使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

2243 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

2023 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 小麦660K芯片里，参考碱基那一列的A/C，哪个才是参考基因组的碱基？

1910 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 芯片数据去除批次效应一般用什么软件 如何操作？

1879 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

问 请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？

2775 浏览 2 关注 3 回答 0 评论