根据GFF和fasta等文件提取某一基因的ATG位点信息，比如具体的位置？

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芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

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如何快速将基因名称转换为基因ID(拟南芥）

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一般报告基因组某个碱基突变是指正链还是负链

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两次运行同一个FQ文件产生的bam文件分析结果存在差异

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基因组组装问题

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请问一下，我的噬菌体基因组fasta文件还是config打头的，是不是需要进一步拼接成scaffold？还是挑选最大的config进行后续分析？

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菌侵染植物的转录组分析中，若菌的一个基因在当前时间没有引起植物基因的变化，过了三个小时后才引起植物基因的变化，如何分析这种现象或如何将这一类基因关联起来，有没有类似的文献推荐？

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如何在差异表达前消除批次效应

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DoubletfFinder Pk值相关计算的问题

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问 安捷伦（Agilent）的数据处理软件Feature Extraction Software的默认的数据标准化的算法是什么？最后得到的值是否做了log2处理？是否是RMA或者MASS的一种？

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问 关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件，为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别？

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问 在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

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问 芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

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问 基因表达芯片的分类问题

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问 请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？

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问 如何判断一篇CHIPseq的文章用的是hg19还是hg38

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问 求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。

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问 表达谱芯片的类型及每种类型能够测定的基因数量如何查询？有没有网站进行过总结？

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问 芯片数据去除批次效应一般用什么软件 如何操作？

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