请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？

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转录本坐标转换成基因组坐标

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对突变组和对照组的某基因表达量做T检验

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已经有不同材料的全基因组二代测序数据，查找是否存在某个已知基因？

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为什么差异基因分析会出现被KO的基因log2FC的数值大于1的情况

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VCONTACT2的结果文件genome_by_genome_overview如何进行统计分类

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绵羊转录组测序后差异表达基因太多了

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【求助】差异表达和特异表达

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基因组组装问题

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关于 截取某基因前后200bp片段

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问 芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

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问 在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

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问 芯片数据去除批次效应一般用什么软件 如何操作？

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问 求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。

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问 Affy包中的MAplot函数的作用是什么？画出的MAplot图如何解读？为何要进行MAplot检查？

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问 如何判断一篇CHIPseq的文章用的是hg19还是hg38

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问 当LIMMA计算计算结果中的调整P值都大于0.05时，可否使用p值<0.05+fc>2来筛选差异表达基因？

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问 请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？

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问 使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

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问 关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件，为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别？

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