基因表达芯片的分类问题 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

3: 关注

1415: 浏览

基因表达芯片的分类问题

芯片数据分析

基因表达表达芯片有双通道和单通道之分，通常所说的cDNA微阵列芯片是双通道芯片，Affymetrix公司的原位合成芯片是单通道芯片，那寡聚核苷酸芯片是双通道还是单通道呢，还是说两种都有，而不同公司的芯片通道数不一样？求大神指点

好问题 0 评论收藏举报

2 回答

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2018-08-23 21:56

双通道是指扫描两次，1次红光，1次绿光；双通道只能表示相对强弱，不能够表示绝对强弱，因此不同样本不能比较，绝对数值大小。单通道就是扫描一次，单色的，可以表示绝对数值，不同样本，不同批次的芯片数据可以进行比较。常见双通道：甲基化芯片；常见单通道：SNP芯片，表达量芯片等等。

赞同 1 0评论

minipeach 前台管理员用户来自于: 重庆市北碚区
2018-08-23 21:56

知乎live有专门讲这个的，可以了解一下。

赞同 0 0评论

关于作者

: TNN 注册会员
这家伙很懒，还没有设置简介

0: 回答

0: 文章

1: 问题

问题动态

发布时间: 2018-08-23 21:36

更新时间: 2018-08-23 21:56

关注人数: 3 人关注

相关问题

细菌基因组分析: 1312 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

信号通路特征基因集的查询？用于作ssGSEA分析。: 1225 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

想要提取指定基因的行信息: 1139 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

转录本坐标转换成基因组坐标: 1849 浏览 4 关注 2 回答 0 评论

无对照的转录组数据如何寻找差异表达基因: 1592 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？: 1174 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

关于tophat2 + cufflinks 得到的差异基因和featureCounts差异基因数目相差太大原因: 1357 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

有关蛋白表达定量的数据库数据打包下载(蛋白组学): 1179 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

创建NT子库以及NT库提取特定物种分类的序列: 1672 浏览 3 关注 2 回答 0 评论

Bulk-RNAseq多组数据差异表达基因的筛选: 1617 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

推荐内容

问使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？: 1318 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？: 1609 浏览 2 关注 3 回答 0 评论

问当LIMMA计算计算结果中的调整P值都大于0.05时，可否使用p值<0.05+fc>2来筛选差异表达基因？: 1556 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。: 1074 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问芯片数据去除批次效应一般用什么软件如何操作？: 1121 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

问在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？: 1174 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问安捷伦（Agilent）的数据处理软件Feature Extraction Software的默认的数据标准化的算法是什么？最后得到的值是否做了log2处理？是否是RMA或者MASS的一种？: 722 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

问芯片数据的批次效应对差异表达基因的计算结果影响大不大？: 1115 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问如何判断一篇CHIPseq的文章用的是hg19还是hg38: 1706 浏览 5 关注 3 回答 0 评论

问表达谱芯片的类型及每种类型能够测定的基因数量如何查询？有没有网站进行过总结？: 1023 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025