为啥NCBI和ensemble相同版本的基因组注释有这么大的差别？

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3D基因组里，如何分清compartment、TAD和chromatin loop

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关于几个数据库对GO注释的疑问

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如何根据现有序列找到它们在三代基因组的编号

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RNA-seq差异分析

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麻烦问下，转录组差异分析，我需要筛掉比对率低的bam文件或者外显子比对率的样本吗

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一般报告基因组某个碱基突变是指正链还是负链

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annovar建立非模式物种注释库后怎么分析

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关于hub基因的问题

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基因组文件中chrUn具体是什么意思呢

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问 表达谱芯片的类型及每种类型能够测定的基因数量如何查询？有没有网站进行过总结？

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问 安捷伦（Agilent）的数据处理软件Feature Extraction Software的默认的数据标准化的算法是什么？最后得到的值是否做了log2处理？是否是RMA或者MASS的一种？

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问 当LIMMA计算计算结果中的调整P值都大于0.05时，可否使用p值<0.05+fc>2来筛选差异表达基因？

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问 如何判断一篇CHIPseq的文章用的是hg19还是hg38

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问 Affy包中的MAplot函数的作用是什么？画出的MAplot图如何解读？为何要进行MAplot检查？

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问 芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

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问 芯片数据去除批次效应一般用什么软件 如何操作？

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问 基因表达芯片的分类问题

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问 小麦660K芯片里，参考碱基那一列的A/C，哪个才是参考基因组的碱基？

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问 关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件，为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别？

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