基因和染色体，lncRNA，mRNA之间的关系是怎样的？

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单细胞——小鼠T细胞注释的markers

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批量获得基因间区及内含子的突变距离最近的基因外显子的距离

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RNA-seq，样本中存在同一基因对应不同的FPKM值

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enhancer结合ATAC-seq进行下游靶基因的寻找策略

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如何计算富集分析里的差异倍数

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宏基因组注释率超低

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H3K27me3这种宽peak怎么找差异？

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关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件，为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别？

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根据基因表达做生存分析OS取出最合适的cutoff

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问 Affy包中的MAplot函数的作用是什么？画出的MAplot图如何解读？为何要进行MAplot检查？

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问 基因表达芯片的分类问题

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问 如何判断一篇CHIPseq的文章用的是hg19还是hg38

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问 芯片数据去除批次效应一般用什么软件 如何操作？

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问 表达谱芯片的类型及每种类型能够测定的基因数量如何查询？有没有网站进行过总结？

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问 当LIMMA计算计算结果中的调整P值都大于0.05时，可否使用p值<0.05+fc>2来筛选差异表达基因？

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问 使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

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问 关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件，为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别？

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问 请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？

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问 求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。

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