细菌基因组分析

1979 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

在riboseq分析中，如何对没有起始密码子和终止密码子的转录本进行三碱基准确性分析？

1755 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

第二代测序碱基出错偏向的原因是什么 为什么第二代测序碱基出错主要以替换为主 稀有碱基会影响测序吗

2232 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

基因组组装问题

2227 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

全基因组关联分析结果与模型选择

1671 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

基因组组装

2404 浏览 4 关注 3 回答 0 评论

参考基因组添加外源基因序列进行比对

3079 浏览 2 关注 5 回答 0 评论

EVM整合基因组注释

1790 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

知道一批基因的具体位置，如何批量的从基因组中取出基因序列？

2221 浏览 3 关注 2 回答 0 评论

根据已知序列查找其第三代基因组编号

1611 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

1730 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 基因表达芯片的分类问题

2025 浏览 3 关注 2 回答 0 评论

问 Affy包中的MAplot函数的作用是什么？画出的MAplot图如何解读？为何要进行MAplot检查？

2196 浏览 3 关注 1 回答 0 评论

问 当LIMMA计算计算结果中的调整P值都大于0.05时，可否使用p值<0.05+fc>2来筛选差异表达基因？

2344 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 如何判断一篇CHIPseq的文章用的是hg19还是hg38

2476 浏览 5 关注 3 回答 0 评论

问 使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

1915 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？

2362 浏览 2 关注 3 回答 0 评论

问 安捷伦（Agilent）的数据处理软件Feature Extraction Software的默认的数据标准化的算法是什么？最后得到的值是否做了log2处理？是否是RMA或者MASS的一种？

1053 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

问 芯片数据去除批次效应一般用什么软件 如何操作？

1584 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

问 芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

1688 浏览 2 关注 1 回答 0 评论