该问题已被锁定!
2
关注
1519
浏览

芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大?

为什么被折叠? 0 个回复被折叠
xiaoyingshi 初级会员 用户来自于: 美国
2018-09-12 19:17
芯片批次效应对差异表达基因计算结果 [b]大 [/b]。   1个经历: 分析数据是[url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE39461]GEO under GSE39461[/url]的前12个样本,做差异表达基因分析时候,LNCaP和ABL细胞系的差异基因均为0,且做hclust​图的时候也很明显发现control和mutant都没有分开。 在去除批次效应之后可以找到差异基因,且hclust​图也会有比较明显效果。

关于作者

问题动态

发布时间
2018-09-12 18:59
更新时间
2018-09-12 19:17
关注人数
2 人关注

相关问题

分析CRISPR 高通量筛选数据
二代转录组去除批次效应
SRR1924430的sra数据与hdf5提取的fastq不一致
去除数据中特异值的方法
二代测序得到测序数据组装完成后如何进行丰度计算
rna-seq数据校正
奇异值分解在处理芯片数据时的意义是什么?
最新的cas9蛋白的sgRNA的数据集
基因表达芯片的分类问题
SRA 数据批量下载
All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025