x <- x[keep.exprs,, keep.lib.sizes=FALSE] 请问一下这条命令该如何解读呢？

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如何根据转录组数据得到新转录本？如何验证一个基因的多个转录本？

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进行转录组数据分析时，进行cuffdiff后的输出文件gene_exp.diff中，一个基因出现了两个不同的表达量数据，应该如何处理？

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seurat包，如何调节大热图左侧的基因字体大小

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如何从NCBI上分别下载所有的RNA病毒和DNA病毒的序列

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cafe 结果可视化如何操作？

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请问在不考虑测序质量的情况下，如何根据bam文件获得比对到指定position的碱基？

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通过富集得到了一些信号通路，我想看看这些通路里哪些是和癌症相关的，如何实现呢？

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chipseq原始文件fastq如何截取DNA长度小于等于260bp进行后续mapping

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如何获得cas9蛋白的高效低效的sgRNA

2013 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 小麦660K芯片里，参考碱基那一列的A/C，哪个才是参考基因组的碱基？

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问 基因表达芯片的分类问题

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问 当LIMMA计算计算结果中的调整P值都大于0.05时，可否使用p值<0.05+fc>2来筛选差异表达基因？

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问 芯片数据去除批次效应一般用什么软件 如何操作？

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问 关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件，为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别？

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问 芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

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问 请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？

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问 求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。

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问 安捷伦（Agilent）的数据处理软件Feature Extraction Software的默认的数据标准化的算法是什么？最后得到的值是否做了log2处理？是否是RMA或者MASS的一种？

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问 Affy包中的MAplot函数的作用是什么？画出的MAplot图如何解读？为何要进行MAplot检查？

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