如何在差异表达前消除批次效应

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WGCNA筛选到感兴趣的模块后，如何找这个模块的hub基因呢？

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rMATS是如何得到外显子的两种isform的？

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链特异性文库（mRNA/lncRNA/circRNA）如何将RNA类型分开？

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生信到底如何入门？？？

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​单细胞RNA-seq，如何计算不同cluster之间的相关性

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chipseq中一共一般有多少峰，可以认为实验是比较靠谱的呢

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请问无参转录组的GO分析如何进行

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如何根据转录组数据得到新转录本？如何验证一个基因的多个转录本？

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seurat中如何通过坐标/细胞名删掉细胞

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问 芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

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问 请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？

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问 小麦660K芯片里，参考碱基那一列的A/C，哪个才是参考基因组的碱基？

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问 使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

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问 当LIMMA计算计算结果中的调整P值都大于0.05时，可否使用p值<0.05+fc>2来筛选差异表达基因？

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问 表达谱芯片的类型及每种类型能够测定的基因数量如何查询？有没有网站进行过总结？

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问 安捷伦（Agilent）的数据处理软件Feature Extraction Software的默认的数据标准化的算法是什么？最后得到的值是否做了log2处理？是否是RMA或者MASS的一种？

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问 求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。

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问 关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件，为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别？

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问 芯片数据去除批次效应一般用什么软件 如何操作？

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