rMATS是如何得到外显子的两种isform的？ - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

2: 关注

1243: 浏览

rMATS是如何得到外显子的两种isform的？

可变剪切

rMATS比较差异是通过比较exon inclusion level 而exon inclusion level是通过exon skipping 和inclusion 两种isform计算的，那么这两种isform是怎么得到的呢？一条reads一条reads的去数嘛？

好问题 0 评论收藏举报

1 回答

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2018-09-08 10:22

rMATS检测的可变剪切主要分成下面5种： [attach]165[/attach] 在检测的时候，需要提供gtf文件，然后通过判断read跨越junction的情况来判断。就是1条reads，1条reads的去数。

赞同 0 0评论

问题动态

发布时间: 2018-09-07 12:01

更新时间: 2018-09-08 10:22

关注人数: 2 人关注

相关问题

统计学，如何从入门到放弃？: 1211 浏览 3 关注 1 回答 0 评论

差异可变剪接分析工具--rMATS-结果分析: 1503 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

seurat中如何通过坐标/细胞名删掉细胞: 2707 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

bivalent domains 如何计算: 1727 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

如何快速将基因名称转换为基因ID(拟南芥）: 1333 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

麻烦问下，转录组差异分析，我需要筛掉比对率低的bam文件或者外显子比对率的样本吗: 1506 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

GAPIT包导出的GWAS结果如何添加新的阈值线？以及GAPIT的结果文件中的nobs、H&B.P.Value、Effect分别是什么意思？: 1791 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

基因symbol注释GEO芯片时，如何把mRNA和lncRNA分别标注出来？: 1220 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

链特异性文库（mRNA/lncRNA/circRNA）如何将RNA类型分开？: 1178 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

在riboseq分析中，如何对没有起始密码子和终止密码子的转录本进行三碱基准确性分析？: 1135 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

推荐内容

问怎么寻找某个基因的不同可变剪切形式？: 1339 浏览 4 关注 2 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025