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如何在差异表达前消除批次效应

大家好，我目前手头有一count数据，但数据存在一个批次效应，预先消除批次效应再通过edgeR做差异表达。想法是这样， raw counts --> remove batch effect --> new counts --> edgeR 但是用removebatcheffect()函数消除批次效应后，count就不是count了，也就不是整数了，不符合导入edgeR的要求。求解谢谢。

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i_thinking 注册会员用户来自于: 美国
2018-08-24 11:12

可以试试deseq2

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: Sugus 注册会员
这家伙很懒，还没有设置简介

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发布时间: 2018-08-24 11:04

更新时间: 2018-08-24 11:12

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