首页
问答
文章
专栏
大咖
更多
话题
帮助
请输入关键字进行搜索
查看更多 "
" 的搜索结果
登录
如何在差异表达前消除批次效应
关注问题
回答问题
该问题已被锁定!
2
关注
796
浏览
如何在差异表达前消除批次效应
edgeR
批次效应
差异表达
大家好, 我目前手头有一count数据,但数据存在一个批次效应,预先消除批次效应再通过edgeR做差异表达。 想法是这样, raw counts --> remove batch effect --> new counts --> edgeR 但是用removebatcheffect()函数消除批次效应后,count就不是count了,也就不是整数了,不符合导入edgeR的要求。 求解 谢谢。
阅读全文
收起全文
关注问题
回答问题
邀请回答
好问题
0
评论
收藏
举报
分享
复制链接
新浪微博
腾讯空间
微信扫一扫
展开
收起
0
评论
为什么被折叠?
0 个回复被折叠
1
回答
热门排序
最新排序
热门排序
只看楼主
i_thinking
注册会员
用户来自于: 美国
2018-08-24 11:12
可以试试deseq2
阅读全文
收起全文
赞同
0
2
评论
分享
复制链接
新浪微博
腾讯空间
微信扫一扫
2
评论
关于作者
Sugus
注册会员
这家伙很懒,还没有设置简介
1
回答
0
文章
1
问题
问题动态
发布时间
2018-08-24 11:04
更新时间
2018-08-24 11:12
关注人数
2 人关注
相关问题
芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大?
701 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
【求助】如何确定时期特定表达基因
626 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
ciriRNA表达量如何计算?
848 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
请问一下,R语言环境下,如何在dataframe数据中添加一个key列呢?具体描述见正文
1063 浏览
4 关注
4 回答
1 评论
转录组组内样本差异大
361 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
log2(fold_change)可以用来做热图吗?遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为0时,怎么办?
698 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
麻烦问下,转录组差异分析,我需要筛掉比对率低的bam文件或者外显子比对率的样本吗
893 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
无对照的转录组数据如何寻找差异表达基因
1000 浏览
2 关注
2 回答
0 评论
用log2(fold_change)数据做热图,遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为inf或-inf时,怎么办?
571 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
根据基因表达做生存分析OS取出最合适的cutoff
708 浏览
1 关注
0 回答
0 评论
推荐内容
问
limma中的Removing heteroscedascity from count data和拟合线性模型是什么意思?
368 浏览
1 关注
0 回答
0 评论
All Rights Reserved Powered BY
WeCenter V4.1.0
© 2024
关于我们
社区规范
你的浏览器版本过低,可能导致网站部分内容不能正常使用!
为了能正常使用网站功能,请使用以下浏览器
Chrome
Firefox
Safari
IE 10+