R基础绘图问题-柱状图加误差线及T测验显著性星号，映射问题如何解决？

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菌侵染植物的转录组分析中，若菌的一个基因在当前时间没有引起植物基因的变化，过了三个小时后才引起植物基因的变化，如何分析这种现象或如何将这一类基因关联起来，有没有类似的文献推荐？

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请问RNA-seq采用poly A(+)策略建库，处理数据时若不去除rRNA会对后续分析有何影响？

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如何判断GO号的层级？

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Affy包中的MAplot函数的作用是什么？画出的MAplot图如何解读？为何要进行MAplot检查？

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是不是单细胞的chip-seq，cut run这些call peak是不需要对照的，我看代码里没有-c.所以Rna-seq的峰图也是不需要control来call peak的吗？

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【求助】如何确定时期特定表达基因

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bivalent domains 如何计算

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【求助】如何判断一个基因是否存在表观修饰的位点？

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求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。

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问 单细胞monocle3，路径很不对，有什么参数是值得调的吗

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问 在用seurat做多样本整合的时候的问题

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问 seurat包，如何调节大热图左侧的基因字体大小

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问 harmony处理批次效应

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问 单细胞——小鼠T细胞注释的markers

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问 使用seurat包，导出特定cluster的细胞-基因counts矩阵。初始数据命名为pbmc

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问 harmony整合样本前需要分别预处理吗？

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问 空转bin_size

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问 scRNA-seq有什么推荐的监督聚类方式吗？

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问 你好chatGPT,可以提供包含双细胞去除的单细胞分析完整流程吗？

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