使用seurat包，导出特定cluster的细胞-基因counts矩阵。出现问题

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希望论坛设置一个新手入门专版

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一般报告基因组某个碱基突变是指正链还是负链

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如何按一个列表对基因型文件进行过滤，剔除不需要的样本？

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想问一个RNA-Seq的流程问题

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当LIMMA计算计算结果中的调整P值都大于0.05时，可否使用p值<0.05+fc>2来筛选差异表达基因？

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基因组组装

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请问一下，我的噬菌体基因组fasta文件还是config打头的，是不是需要进一步拼接成scaffold？还是挑选最大的config进行后续分析？

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整合scRNA和scATAC相关问题请教

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宏基因组进行binning分析

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问 进行转录组数据分析时，进行cuffdiff后的输出文件gene_exp.diff中，一个基因出现了两个不同的表达量数据，应该如何处理？

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问 对突变组和对照组的某基因表达量做T检验

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问 log2(fold_change)可以用来做热图吗？遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为0时，怎么办？

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问 HISAT2建立索引

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问 ciriRNA表达量如何计算？

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问 synapser无法加载

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问 转录组定量结果为0

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问 用log2(fold_change)数据做热图，遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为inf或-inf时，怎么办？

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问 转录组和代谢组联合分析的方法有那些？

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问 不同比对软件出的结果能进行比较吗？

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