基因表达

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基因互作网络和蛋白互作网络

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根据GFF和fasta等文件提取某一基因的ATG位点信息，比如具体的位置？

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小麦660K芯片里，参考碱基那一列的A/C，哪个才是参考基因组的碱基？

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ciriRNA表达量如何计算？（更）

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使用seurat包，导出特定cluster的细胞-基因counts矩阵。初始数据命名为pbmc

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关于hub基因的问题

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基因组文件中chrUn具体是什么意思呢

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单细胞seurat对象的基因过滤

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如何根据转录组数据得到新转录本？如何验证一个基因的多个转录本？

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问 无对照的转录组数据如何寻找差异表达基因

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问 链特异性文库（mRNA/lncRNA/circRNA）如何将RNA类型分开？

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问 请教一个问题，一个转录因子TF只会调控位于同一条链的基因，还是有可能调控反义链的基因？

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问 log2(fold_change)可以用来做热图吗？遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为0时，怎么办？

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问 二代转录组去除批次效应

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问 进行转录组数据分析时，进行cuffdiff后的输出文件gene_exp.diff中，一个基因出现了两个不同的表达量数据，应该如何处理？

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问 转录组和代谢组联合分析的方法有那些？

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问 我测了一批寄生蜂的转录组样品，FPKM值感觉好奇怪，合理吗？

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问 如何根据转录组数据得到新转录本？如何验证一个基因的多个转录本？

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问 HISAT2建立索引

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