在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

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芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

2020 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

蛋白表达矩阵

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3D基因组里，如何分清compartment、TAD和chromatin loop

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基因互作网络和蛋白互作网络

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一般报告基因组某个碱基突变是指正链还是负链

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【求助】如何确定一种基因ID的类型

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几个酶有许多共同基因，这些酶产物之间存在什么关系

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群体内同源基因的所有变异

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噬菌体比较基因组分析流程

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问 WGCNA

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问 请教一个问题，一个转录因子TF只会调控位于同一条链的基因，还是有可能调控反义链的基因？

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问 我测了一批寄生蜂的转录组样品，FPKM值感觉好奇怪，合理吗？

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问 二代转录组去除批次效应

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问 聚类数据标准化

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问 转录组定量结果为0

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问 菌侵染植物的转录组分析中，若菌的一个基因在当前时间没有引起植物基因的变化，过了三个小时后才引起植物基因的变化，如何分析这种现象或如何将这一类基因关联起来，有没有类似的文献推荐？

2021 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 synapser无法加载

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问 转录组和代谢组联合分析的方法有那些？

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问 进行转录组数据分析时，进行cuffdiff后的输出文件gene_exp.diff中，一个基因出现了两个不同的表达量数据，应该如何处理？

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