如何按一个列表对基因型文件进行过滤，剔除不需要的样本？

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在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

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WGCNA筛选到感兴趣的模块后，如何找这个模块的hub基因呢？

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如何快速将基因名称转换为基因ID(拟南芥）

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测了实验组与对照组的mRNA与miRNA的转录组，miRNA-mRNA互作分析网络怎么处理呢？

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无对照的转录组数据如何寻找差异表达基因

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请教一个问题，一个转录因子TF只会调控位于同一条链的基因，还是有可能调控反义链的基因？

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如何提取比对上某一个基因或者某一段序列的所有reads

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ciriRNA表达量如何计算？（更）

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蛋白表达矩阵

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问 几个酶有许多共同基因，这些酶产物之间存在什么关系

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问 synapser无法加载

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问 链特异性文库（mRNA/lncRNA/circRNA）如何将RNA类型分开？

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问 菌侵染植物的转录组分析中，若菌的一个基因在当前时间没有引起植物基因的变化，过了三个小时后才引起植物基因的变化，如何分析这种现象或如何将这一类基因关联起来，有没有类似的文献推荐？

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问 log2(fold_change)可以用来做热图吗？遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为0时，怎么办？

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问 转录组定量结果为0

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问 请教一个问题，一个转录因子TF只会调控位于同一条链的基因，还是有可能调控反义链的基因？

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问 转录组测序问题

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问 原核生物的转录组测序为什么比真核的贵？

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问 用log2(fold_change)数据做热图，遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为inf或-inf时，怎么办？

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