测了实验组与对照组的mRNA与miRNA的转录组，miRNA-mRNA互作分析网络怎么处理呢？

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关于基因间的相关性分析

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如何对特征数量少的空间蛋白组数据进行细胞聚类？

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基因本体论分析上下调基因差异

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macs2进行peak calling

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GEO数据芯片数据基因名转换

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常用的对测序序列进行聚类分析的软件有什么？及其使用的了什么算法？

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请问一下，如何根据基因名批量下载CDS区的序列？

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已经有不同材料的全基因组二代测序数据，查找是否存在某个已知基因？

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Hichip得到loop数据如何注释？

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问 ciriRNA表达量如何计算？

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问 请教一个问题，一个转录因子TF只会调控位于同一条链的基因，还是有可能调控反义链的基因？

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问 转录组

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问 二代转录组去除批次效应

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问 ciriRNA表达量如何计算？（更）

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问 菌侵染植物的转录组分析中，若菌的一个基因在当前时间没有引起植物基因的变化，过了三个小时后才引起植物基因的变化，如何分析这种现象或如何将这一类基因关联起来，有没有类似的文献推荐？

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问 请问hisat2+stringtie+deseq2的标准流程

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问 对突变组和对照组的某基因表达量做T检验

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