该问题已被锁定!
2
关注
3149
浏览

二代转录组去除批次效应

查看全部 3 个回答

song 注册会员 用户来自于: 北京市
2023-06-03 17:28

Combat就是专门来去除二代转录组批次效应的,似乎DEseq2内部也自带有去除批次效应的函数

关于作者

TTT001 注册会员

这家伙很懒,还没有设置简介

问题动态

发布时间
2023-06-02 18:40
更新时间
2023-06-05 13:48
关注人数
2 人关注

相关问题

转录组组内样本差异大
芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大?
非已知转录因子预测
转录组
芯片数据去除批次效应一般用什么软件 如何操作?
植物基因组组装过程中如何去除质体序列
请问hemmer是否可以使用转录组搜索HMM库?
为什么单细胞测序需要对UMI去重而二代测序不需要去重?
测了实验组与对照组的mRNA与miRNA的转录组,miRNA-mRNA互作分析网络怎么处理呢?
harmony处理批次效应

推荐内容

我测了一批寄生蜂的转录组样品,FPKM值感觉好奇怪,合理吗?
ciriRNA表达量如何计算?
请问hisat2+stringtie+deseq2的标准流程
ciriRNA表达量如何计算?(更)
对突变组和对照组的某基因表达量做T检验
进行转录组数据分析时,进行cuffdiff后的输出文件gene_exp.diff中,一个基因出现了两个不同的表达量数据,应该如何处理?
无对照的转录组数据如何寻找差异表达基因
原核生物的转录组测序为什么比真核的贵?
不同比对软件出的结果能进行比较吗?
WGCNA
All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025