样本批次问题

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转录组

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已经有不同材料的全基因组二代测序数据，查找是否存在某个已知基因？

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菌侵染植物的转录组分析中，若菌的一个基因在当前时间没有引起植物基因的变化，过了三个小时后才引起植物基因的变化，如何分析这种现象或如何将这一类基因关联起来，有没有类似的文献推荐？

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第二代测序碱基出错偏向的原因是什么 为什么第二代测序碱基出错主要以替换为主 稀有碱基会影响测序吗

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去除数据中特异值的方法

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如何根据转录组数据得到新转录本？如何验证一个基因的多个转录本？

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转录组

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请问hemmer是否可以使用转录组搜索HMM库？

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二代测序中计算有多少个count数才有研究意义?

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问 转录组测序问题

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问 ciriRNA表达量如何计算？（更）

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问 WGCNA

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问 几个酶有许多共同基因，这些酶产物之间存在什么关系

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问 进行转录组数据分析时，进行cuffdiff后的输出文件gene_exp.diff中，一个基因出现了两个不同的表达量数据，应该如何处理？

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问 如何根据转录组数据得到新转录本？如何验证一个基因的多个转录本？

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问 不同比对软件出的结果能进行比较吗？

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问 请问hisat2+stringtie+deseq2的标准流程

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问 原核生物的转录组测序为什么比真核的贵？

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问 无对照的转录组数据如何寻找差异表达基因

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