在做普通转录组的跨物种分析时，，用什么标准化方法对counts进行矫正好呢？目前有用过tmm矫正，最大最小化 ，Z分都试过，效果都不行，，同时用edger做差异分析时，两物种差异基因太多了，有近35%，中间肯定是有问题的，但是应该从哪方面入手去解决这个问题呢？
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在做普通转录组的跨物种分析时，对counts进行矫正一般需要考虑以下几个方面：
另外，在使用edger进行差异分析时，可以考虑以下几个方面：
综上所述，进行跨物种转录组分析时，需要考虑多个因素对counts进行矫正，并且需要注意差异分析的阈值、样本匹配和基因注释的准确性等问题。
