如何按一个列表对基因型文件进行过滤，剔除不需要的样本？

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enhancer结合ATAC-seq进行下游靶基因的寻找策略

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噬菌体比较基因组分析流程

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根据基因表达做生存分析OS取出最合适的cutoff

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一个cohort中，某基因count大于多少才有意义？

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问题：如何筛选WGCNA分析得出的consensus module中的hub基因？

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3D基因组里，如何分清compartment、TAD和chromatin loop

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蛋白表达矩阵

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已经有不同材料的全基因组二代测序数据，查找是否存在某个已知基因？

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请问如何查询某基因的详细的Biological Function？

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问 ciriRNA表达量如何计算？

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问 请教一个问题，一个转录因子TF只会调控位于同一条链的基因，还是有可能调控反义链的基因？

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问 植物TWAS流程

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问 HISAT2建立索引

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问 聚类数据标准化

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问 进行转录组数据分析时，进行cuffdiff后的输出文件gene_exp.diff中，一个基因出现了两个不同的表达量数据，应该如何处理？

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问 用log2(fold_change)数据做热图，遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为inf或-inf时，怎么办？

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问 转录组和代谢组联合分析的方法有那些？

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问 几个酶有许多共同基因，这些酶产物之间存在什么关系

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问 菌侵染植物的转录组分析中，若菌的一个基因在当前时间没有引起植物基因的变化，过了三个小时后才引起植物基因的变化，如何分析这种现象或如何将这一类基因关联起来，有没有类似的文献推荐？

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