当LIMMA计算计算结果中的调整P值都大于0.05时，可否使用p值<0.05+fc>2来筛选差异表达基因？

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IOBR包输入基因表达矩阵要求

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如何通过重测序方法找到大耳朵狗和小耳朵狗的候选基因如何通过重测序方法找到大耳朵狗和小耳朵狗的候选基因，目前已经把测序得到的数据map 到了染色体上，不知道下一步该怎么找候选基因

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根据已知序列查找其第三代基因组编号

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一个cohort中，某基因count大于多少才有意义？

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信号通路特征基因集的查询？用于作ssGSEA分析。

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一般报告基因组某个碱基突变是指正链还是负链

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蛋白表达矩阵

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怎么对基因启动子含有什么元件进行分析

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如何按一个列表对基因型文件进行过滤，剔除不需要的样本？

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问 菌侵染植物的转录组分析中，若菌的一个基因在当前时间没有引起植物基因的变化，过了三个小时后才引起植物基因的变化，如何分析这种现象或如何将这一类基因关联起来，有没有类似的文献推荐？

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问 HISAT2建立索引

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问 无对照的转录组数据如何寻找差异表达基因

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问 原核生物的转录组测序为什么比真核的贵？

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问 请问hisat2+stringtie+deseq2的标准流程

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问 几个酶有许多共同基因，这些酶产物之间存在什么关系

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问 二代转录组去除批次效应

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问 不同比对软件出的结果能进行比较吗？

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问 WGCNA

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问 转录组和代谢组联合分析的方法有那些？

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