细菌的参考基因组下载 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

2: 关注

1798: 浏览

细菌的参考基因组下载

我想下载E.coli的参考基因组，但是在ucsc和ensembl上似乎都找不到，请问我可以在哪里下载到E.coli的参考基因组呢？感谢孟叔和网友们的解答

好问题 0 评论收藏举报

1 回答

chatGPT机器人机器人用户来自于: 北京市
2023-06-06 08:39

您好！针对您的问题，您可以在NCBI网站上下载E.coli的参考基因组。具体步骤如下：

进入NCBI网站（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/）。
在网站搜索框中输入“Escherichia coli”，然后点击搜索按钮。
在搜索结果页面中，选择“Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655”（或其他您需要的参考菌株），进入该菌株的信息页面。
在信息页面中，选择“NCBI Reference Sequence: NC_000913.3”（或其他您需要的参考序列），进入该序列的页面。
在该序列页面中，选择“Send to” -> “Complete Record” -> “File” -> “FASTA” -> “Create File”。
下载生成的FASTA文件，即可获得E.coli的参考基因组。

希望我的回答能够帮到您！如有疑问，欢迎继续提问。

赞同 0 0评论

关于作者

: 想搞生信的小菜鸡 注册会员
00后小萌新

0: 回答

0: 文章

2: 问题

问题动态

发布时间: 2023-06-06 08:29

更新时间: 2023-06-06 11:56

关注人数: 2 人关注

相关问题

GEOquery下载GEO数据软件报错: 2655 浏览 4 关注 3 回答 0 评论

请问UCSC上下载的参考基因组中这个文件是什么含义: 1405 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

TCGA数据下载: 1412 浏览 2 关注 1 回答 2 评论

如何根据现有序列找到它们在三代基因组的编号: 2007 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

根据已知序列查找其第三代基因组编号: 1528 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

如何从NCBI上分别下载所有的RNA病毒和DNA病毒的序列: 2563 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

annotatePeak peak基因组注释: 2440 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

有关蛋白表达定量的数据库数据打包下载(蛋白组学): 1754 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

怎么从ncbi上下载gbff格式的文件: 2189 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

如果在基因组中鉴定到病毒序列，如何从生信角度判断它是EVEs还是HGTs: 1563 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

推荐内容

问 roary报错，没有找到字母表如图: 2376 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 PacBio纠错算法的研究: 1639 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

问宏基因组进行binning分析: 2558 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问关于拟南芥着色粒附近的变异数量: 1666 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问网上下载的DNA sequence 为什么前面和后面有一段N是什么意思？: 1493 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 sgRNA的GC content 是什么意思，该如何计算: 2209 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问 Hic_pro在mergeSAM时遇到这个问题，是不是CPU占用guo: 1599 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问不同种群的the overall synonymous diversity (πS)是什么意思: 1576 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问运行roary软件不出结果，命令行用了这种: 2692 浏览 1 关注 2 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025