如何提取比对上某一个基因或者某一段序列的所有reads

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单细胞seurat对象的基因过滤

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WGCNA筛选到感兴趣的模块后，如何找这个模块的hub基因呢？

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RNA-seq，样本中存在同一基因对应不同的FPKM值

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关于基因间的相关性分析

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用log2(fold_change)数据做热图，遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为inf或-inf时，怎么办？

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求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。

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ATAC-seq不同测序量样本的差异比较

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基因本体论分析上下调基因差异

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IOBR包输入基因表达矩阵要求

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问 小麦660K芯片里，参考碱基那一列的A/C，哪个才是参考基因组的碱基？

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问 关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件，为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别？

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问 表达谱芯片的类型及每种类型能够测定的基因数量如何查询？有没有网站进行过总结？

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问 如何判断一篇CHIPseq的文章用的是hg19还是hg38

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问 使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

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问 在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

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问 请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？

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问 Affy包中的MAplot函数的作用是什么？画出的MAplot图如何解读？为何要进行MAplot检查？

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问 芯片数据去除批次效应一般用什么软件 如何操作？

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问 求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。

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