基因组组装问题

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芯片数据去除批次效应一般用什么软件 如何操作？

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3D基因组里compartment里一般是包含好多TAD的，但这图为什么compartment数量比TAD多这么多呢

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宏基因组注释率超低

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噬菌体比较基因组分析流程

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如何根据现有序列找到它们在三代基因组的编号

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chipseq中一共一般有多少峰，可以认为实验是比较靠谱的呢

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3D基因组里，如何分清compartment、TAD和chromatin loop

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细菌基因组分析

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全基因组关联分析结果与模型选择

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问 宏基因组注释率超低

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问 如果在基因组中鉴定到病毒序列，如何从生信角度判断它是EVEs还是HGTs

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问 EVEs和HGTs之间关系如何

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问 为啥NCBI和ensemble相同版本的基因组注释有这么大的差别？

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问 批量获得基因间区及内含子的突变距离最近的基因外显子的距离

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