一个cohort中，某基因count大于多少才有意义？

1388 浏览 1 关注 0 回答 1 评论

菌侵染植物的转录组分析中，若菌的一个基因在当前时间没有引起植物基因的变化，过了三个小时后才引起植物基因的变化，如何分析这种现象或如何将这一类基因关联起来，有没有类似的文献推荐？

2456 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

关于tophat2 + cufflinks 得到的差异基因和featureCounts差异基因数目相差太大原因

2924 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

植物基因组组装过程中如何去除质体序列

2950 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

如何根据现有序列找到它们在三代基因组的编号

2816 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

2675 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

验证数据集基因名称

2523 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

创建NT子库以及NT库提取特定物种分类的序列

3519 浏览 3 关注 2 回答 0 评论

几个酶有许多共同基因，这些酶产物之间存在什么关系

2735 浏览 2 关注 2 回答 1 评论

关于基因对某种疾病的影响的问题

1994 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 Affy包中的MAplot函数的作用是什么？画出的MAplot图如何解读？为何要进行MAplot检查？

3004 浏览 3 关注 1 回答 0 评论

问 表达谱芯片的类型及每种类型能够测定的基因数量如何查询？有没有网站进行过总结？

2146 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 当LIMMA计算计算结果中的调整P值都大于0.05时，可否使用p值<0.05+fc>2来筛选差异表达基因？

3060 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

2500 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 如何判断一篇CHIPseq的文章用的是hg19还是hg38

3505 浏览 5 关注 3 回答 0 评论

问 小麦660K芯片里，参考碱基那一列的A/C，哪个才是参考基因组的碱基？

2354 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

2675 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 安捷伦（Agilent）的数据处理软件Feature Extraction Software的默认的数据标准化的算法是什么？最后得到的值是否做了log2处理？是否是RMA或者MASS的一种？

1463 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

问 芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

2468 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 芯片数据去除批次效应一般用什么软件 如何操作？

2241 浏览 1 关注 1 回答 0 评论