二代测序得到测序数据组装完成后如何进行丰度计算

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请问RNA-seq采用poly A(+)策略建库，处理数据时若不去除rRNA会对后续分析有何影响？

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数据下载

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去除数据中特异值的方法

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关于几个数据库对GO注释的疑问

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如何使用seqtk按照比例随机提取单细胞数据？

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GWAS 数据存储网站

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去除批次效应选定靶标细胞群后如何进行亚群分析？

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不同测序平台的scRNAseq数据集整合（10✖️、smart-seq）

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TCGA数据下载

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问 如何判断一篇CHIPseq的文章用的是hg19还是hg38

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问 在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

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问 基因表达芯片的分类问题

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问 使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

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问 关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件，为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别？

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问 求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。

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问 请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？

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问 芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

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问 安捷伦（Agilent）的数据处理软件Feature Extraction Software的默认的数据标准化的算法是什么？最后得到的值是否做了log2处理？是否是RMA或者MASS的一种？

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问 Affy包中的MAplot函数的作用是什么？画出的MAplot图如何解读？为何要进行MAplot检查？

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