关于几个数据库对GO注释的疑问

2148 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

请问RNA-seq采用poly A(+)策略建库，处理数据时若不去除rRNA会对后续分析有何影响？

1709 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

如何对特征数量少的空间蛋白组数据进行细胞聚类？

2333 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

去除批次效应选定靶标细胞群后如何进行亚群分析？

2790 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

数据下载

1837 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

基因表达芯片的分类问题

2026 浏览 3 关注 2 回答 0 评论

GWAS 数据存储网站

1135 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

GEOquery下载GEO数据软件报错

2968 浏览 4 关注 3 回答 0 评论

聚类数据标准化

2419 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

如何在差异表达前消除批次效应

1843 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。

1587 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？

2362 浏览 2 关注 3 回答 0 评论

问 如何判断一篇CHIPseq的文章用的是hg19还是hg38

2476 浏览 5 关注 3 回答 0 评论

问 表达谱芯片的类型及每种类型能够测定的基因数量如何查询？有没有网站进行过总结？

1517 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件，为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别？

2435 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问 在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

1730 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 小麦660K芯片里，参考碱基那一列的A/C，哪个才是参考基因组的碱基？

1619 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 当LIMMA计算计算结果中的调整P值都大于0.05时，可否使用p值<0.05+fc>2来筛选差异表达基因？

2345 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

1916 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 安捷伦（Agilent）的数据处理软件Feature Extraction Software的默认的数据标准化的算法是什么？最后得到的值是否做了log2处理？是否是RMA或者MASS的一种？

1054 浏览 1 关注 0 回答 0 评论