分析CRISPR 高通量筛选数据

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验证数据集基因名称

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RNA结合蛋白数据库

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bulk-RNAseq数据集整合

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SRA 数据批量下载

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SRR1924430的sra数据与hdf5提取的fastq不一致

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请问一下，R语言环境下，如何在dataframe数据中添加一个key列呢？具体描述见正文

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基因symbol注释GEO芯片时，如何把mRNA和lncRNA分别标注出来？

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数据下载

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来自不同project的RNA-Seq数据可以直接合并分析吗？

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问 基因表达芯片的分类问题

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问 求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。

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问 安捷伦（Agilent）的数据处理软件Feature Extraction Software的默认的数据标准化的算法是什么？最后得到的值是否做了log2处理？是否是RMA或者MASS的一种？

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问 请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？

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问 表达谱芯片的类型及每种类型能够测定的基因数量如何查询？有没有网站进行过总结？

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问 当LIMMA计算计算结果中的调整P值都大于0.05时，可否使用p值<0.05+fc>2来筛选差异表达基因？

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问 在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

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问 小麦660K芯片里，参考碱基那一列的A/C，哪个才是参考基因组的碱基？

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问 Affy包中的MAplot函数的作用是什么？画出的MAplot图如何解读？为何要进行MAplot检查？

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问 如何判断一篇CHIPseq的文章用的是hg19还是hg38

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