Hichip得到loop数据如何注释？ - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

2: 关注

2075: 浏览

Hichip得到loop数据如何注释？

hichip

老铁们，请问如何给Hichip得到的loop数据进行基因注释呢？谢谢

好问题 0 评论收藏举报

2 回答

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2018-10-11 16:57

最常用的注释软件是homer软件里面的annotationPeaks，我建议你去看一下下面的链接。注释的信息非常完整。 [url]http://homer.ucsd.edu/homer/ngs/annotation.html[/url]

赞同 0 0评论

i_thinking 注册会员用户来自于: 美国
2018-10-11 16:58

谢谢，孟老师。

赞同 0 0评论

关于作者

: i_thinking 注册会员
这家伙很懒，还没有设置简介

5: 回答

0: 文章

4: 问题

问题动态

发布时间: 2018-10-11 15:05

更新时间: 2018-10-11 16:58

关注人数: 2 人关注

相关问题

如何通过重测序方法找到大耳朵狗和小耳朵狗的候选基因如何通过重测序方法找到大耳朵狗和小耳朵狗的候选基因，目前已经把测序得到的数据map 到了染色体上，不知道下一步该怎么找候选基因: 1877 浏览 3 关注 2 回答 0 评论

rna-seq数据校正: 2098 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

GTEx项目的数据类型: 1922 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

GEO数据芯片数据基因名转换: 1601 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

使用seurat包，导出特定cluster的细胞-基因counts矩阵。初始数据命名为pbmc: 2294 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

用log2(fold_change)数据做热图，遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为inf或-inf时，怎么办？: 2309 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

关于tophat2 + cufflinks 得到的差异基因和featureCounts差异基因数目相差太大原因: 2043 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

用wget 在服务器上用wget下载ENcode里的chip-seq测序原始数据，提示可以connected,但一直no data received ?: 2122 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

TCGA数据下载: 1499 浏览 2 关注 1 回答 2 评论

如何下载指定文献的原始数据？？: 1701 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

推荐内容

问 Hi-C热图人工纠错: 1849 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025