FPKM计算问题

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如何提取比对上某一个基因或者某一段序列的所有reads

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参考基因组添加外源基因序列进行比对

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怎么对基因启动子含有什么元件进行分析

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bowtie2 参考基因组注释 比对

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RNA-seq，样本中存在同一基因对应不同的FPKM值

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芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

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验证数据集基因名称

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基因表达

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Bulk-RNAseq多组数据差异表达基因的筛选

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问 请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？

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问 小麦660K芯片里，参考碱基那一列的A/C，哪个才是参考基因组的碱基？

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问 芯片数据去除批次效应一般用什么软件 如何操作？

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问 Affy包中的MAplot函数的作用是什么？画出的MAplot图如何解读？为何要进行MAplot检查？

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问 芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

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问 使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

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问 如何判断一篇CHIPseq的文章用的是hg19还是hg38

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问 基因表达芯片的分类问题

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问 表达谱芯片的类型及每种类型能够测定的基因数量如何查询？有没有网站进行过总结？

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问 求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。

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