转录本坐标转换成基因组坐标

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求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。

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ciriRNA表达量如何计算？

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一般报告基因组某个碱基突变是指正链还是负链

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sgRNA的GC content 是什么意思，该如何计算

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使用seurat包，导出特定cluster的细胞-基因counts矩阵。出现问题

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请问一下，我的噬菌体基因组fasta文件还是config打头的，是不是需要进一步拼接成scaffold？还是挑选最大的config进行后续分析？

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【求助】如何判断一个基因是否存在表观修饰的位点？

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关于 截取某基因前后200bp片段

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为啥NCBI和ensemble相同版本的基因组注释有这么大的差别？

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问 使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

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问 请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？

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问 Affy包中的MAplot函数的作用是什么？画出的MAplot图如何解读？为何要进行MAplot检查？

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问 基因表达芯片的分类问题

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问 小麦660K芯片里，参考碱基那一列的A/C，哪个才是参考基因组的碱基？

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问 关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件，为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别？

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问 芯片数据去除批次效应一般用什么软件 如何操作？

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问 在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

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问 表达谱芯片的类型及每种类型能够测定的基因数量如何查询？有没有网站进行过总结？

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问 安捷伦（Agilent）的数据处理软件Feature Extraction Software的默认的数据标准化的算法是什么？最后得到的值是否做了log2处理？是否是RMA或者MASS的一种？

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