细菌基因组分析

2711 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

基因组组装问题

2897 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

为啥NCBI和ensemble相同版本的基因组注释有这么大的差别？

3184 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

请问在不考虑测序质量的情况下，如何根据bam文件获得比对到指定position的碱基？

4537 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

根据已知序列查找其第三代基因组编号

2182 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

宏基因组进行binning分析

3354 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

如果在基因组中鉴定到病毒序列，如何从生信角度判断它是EVEs还是HGTs

2236 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

请问UCSC上下载的参考基因组中这个文件是什么含义

2065 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

如何根据现有序列找到它们在三代基因组的编号

2673 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

一般报告基因组某个碱基突变是指正链还是负链

1984 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 如何判断一篇CHIPseq的文章用的是hg19还是hg38

3316 浏览 5 关注 3 回答 0 评论

问 使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

2529 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 安捷伦（Agilent）的数据处理软件Feature Extraction Software的默认的数据标准化的算法是什么？最后得到的值是否做了log2处理？是否是RMA或者MASS的一种？

1393 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

问 芯片数据去除批次效应一般用什么软件 如何操作？

2116 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

问 芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

2322 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？

3163 浏览 2 关注 3 回答 0 评论

问 Affy包中的MAplot函数的作用是什么？画出的MAplot图如何解读？为何要进行MAplot检查？

2853 浏览 3 关注 1 回答 0 评论

问 当LIMMA计算计算结果中的调整P值都大于0.05时，可否使用p值<0.05+fc>2来筛选差异表达基因？

2919 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件，为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别？

3443 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问 求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。

2111 浏览 2 关注 1 回答 0 评论