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SRR1924430的sra数据与hdf5提取的fastq不一致

数据处理

从SRA下载了SRR194430.sra文件，fastq-dump转为fastq时，出现如下情况 [attach]267[/attach] 不知其因，所以又从EBI下载了SRR1924430的fastq文件，结果，emmm，EBI的fastq文件就是sra转了一部分的那个fastq文件。两个文件都是1030条reads。然后下载的SRR1924430_hdf5.tgz解压后，使用工具pbh5tools参数ccs提取fastq，emmm，reads数量：1025条。所以，问题1：为什么会出现如图所示的情况（没有输出的reads是什么，为什么不输出）？问题2：为什么从hdf5文件中提取的reads数量与下载的fastq中reads数量不一致?

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发布时间: 2018-09-25 17:19

更新时间: 2018-09-25 17:19

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