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rna-seq数据校正

生信问题

请问，rna-seq数据处理完之后发现gapdh的值差异较大，可以通过gapdh来校正其它基因的表达量吗？

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2 回答

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2018-09-27 14:39

一般来说，不这么办，表达量特别高的gene本身的表达量用RNA-Seq衡量就不是很准；如果真的要确定是否有变化，你需要选择多个内参然后进行qPCR。以实验的结果为准。还有一个办法是掺入spike-in，最常用的是ERCC序列。

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i_thinking 注册会员用户来自于: 北京市
2018-09-27 15:04

好的，感谢孟老师

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: i_thinking 注册会员
这家伙很懒，还没有设置简介

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发布时间: 2018-09-26 09:49

更新时间: 2018-09-27 15:04

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