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在进行TCGA的TPM数据或者GEO芯片数据聚类分析时,是否需要对数据进行标准化处理?如果进行标准化处理,是对每个样本的所有基因表达量进行标准化,还是对每个基因在不同样本中的数据进行标准化?
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如果已经都是TPM了,就直接聚类就行。
有的时候喜欢对TPM或者FPKM进行 log2处理。
具体你可以看看哪个效果好。
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