RNA-seq差异分析

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公司双端测序的数据R1R2处理

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SRA、SRP、SRX、RUN等一些列NCBI genebank数据库中的一些缩略词官方解释或者全称，谢谢，虽然做了一段时间生信但是对这些小问题并没有重视，希望大家解答

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用atac-seq数据计算的TSS enrichment score

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pheatmap画图的数据导入问题

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Hichip得到loop数据如何注释？

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TCGA数据下载

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转录组数据样本聚类结果不理想

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单细胞数据整合

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如何通过重测序方法找到大耳朵狗和小耳朵狗的候选基因如何通过重测序方法找到大耳朵狗和小耳朵狗的候选基因，目前已经把测序得到的数据map 到了染色体上，不知道下一步该怎么找候选基因

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问 ciriRNA表达量如何计算？

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问 如何利用利用TPM或者FPKM完成DESeq2完成的工作?

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问 转录组

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问 log2(fold_change)可以用来做热图吗？遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为0时，怎么办？

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问 肿瘤亚型分析

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问 普通转录组的跨物种分析

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问 麻烦问下，转录组差异分析，我需要筛掉比对率低的bam文件或者外显子比对率的样本吗

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问 samtools 有错误

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问 ciriRNA表达量如何计算？（更）

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