无对照的转录组数据如何寻找差异表达基因

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关于tophat2 + cufflinks 得到的差异基因和featureCounts差异基因数目相差太大原因

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log2后的数据进行Wilcoxon秩和检验对结果存在什么影响？

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如何使用seqtk按照比例随机提取单细胞数据？

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使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

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在使用cutadapt出现了看不懂的报错，使用snakemake编写的代码和报错的log文件内容放在下面，希望大神解惑帮忙看看是出现了什么问题？

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问 Closed Reference,Open Reference,Denovo聚类分析的联系和区别？

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问 常用的对测序序列进行聚类分析的软件有什么？及其使用的了什么算法？

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