麻烦问下，转录组差异分析，我需要筛掉比对率低的bam文件或者外显子比对率的样本吗

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无对照的转录组数据如何寻找差异表达基因

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请问hemmer是否可以使用转录组搜索HMM库？

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转录组

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转录本坐标转换成基因组坐标

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转录组

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在仅有每个样本(有3个repeat)所有转录本的fpkm的情况下，如何利用cuffdiff进行差异基因分析。

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请教一个问题，一个转录因子TF只会调控位于同一条链的基因，还是有可能调控反义链的基因？

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转录组组内样本差异大

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测了实验组与对照组的mRNA与miRNA的转录组，miRNA-mRNA互作分析网络怎么处理呢？

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问 log2(fold_change)可以用来做热图吗？遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为0时，怎么办？

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问 用log2(fold_change)数据做热图，遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为inf或-inf时，怎么办？

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问 我测了一批寄生蜂的转录组样品，FPKM值感觉好奇怪，合理吗？

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问 无对照的转录组数据如何寻找差异表达基因

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问 HISAT2建立索引

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问 进行转录组数据分析时，进行cuffdiff后的输出文件gene_exp.diff中，一个基因出现了两个不同的表达量数据，应该如何处理？

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问 转录组和代谢组联合分析的方法有那些？

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问 对突变组和对照组的某基因表达量做T检验

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问 ciriRNA表达量如何计算？

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问 不同比对软件出的结果能进行比较吗？

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