无对照的转录组数据如何寻找差异表达基因

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芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

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测了实验组与对照组的mRNA与miRNA的转录组，miRNA-mRNA互作分析网络怎么处理呢？

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非已知转录因子预测

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stringtie和gffcompare处理转录本的问题

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去除数据中特异值的方法

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去除批次效应选定靶标细胞群后如何进行亚群分析？

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已经有不同材料的全基因组二代测序数据，查找是否存在某个已知基因？

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麻烦问下，转录组差异分析，我需要筛掉比对率低的bam文件或者外显子比对率的样本吗

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如何在差异表达前消除批次效应

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问 聚类数据标准化

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问 请教一个问题，一个转录因子TF只会调控位于同一条链的基因，还是有可能调控反义链的基因？

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问 我测了一批寄生蜂的转录组样品，FPKM值感觉好奇怪，合理吗？

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问 转录组测序问题

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问 菌侵染植物的转录组分析中，若菌的一个基因在当前时间没有引起植物基因的变化，过了三个小时后才引起植物基因的变化，如何分析这种现象或如何将这一类基因关联起来，有没有类似的文献推荐？

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问 转录组和代谢组联合分析的方法有那些？

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问 用log2(fold_change)数据做热图，遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为inf或-inf时，怎么办？

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问 无对照的转录组数据如何寻找差异表达基因

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问 WGCNA

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问 原核生物的转录组测序为什么比真核的贵？

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