为啥NCBI和ensemble相同版本的基因组注释有这么大的差别？

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使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

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耐药细菌的比较基因组分析流程和机制探索

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根据已知序列查找其第三代基因组编号

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麻烦问下，转录组差异分析，我需要筛掉比对率低的bam文件或者外显子比对率的样本吗

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蛋白表达矩阵

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信号通路特征基因集的查询？用于作ssGSEA分析。

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RNA-seq不同样本多个生物学重复不同处理条件下的如何找差异基因

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获取所有基因的转录起始位点（TSS）

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使用seurat包，导出特定cluster的细胞-基因counts矩阵。出现问题

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问 当LIMMA计算计算结果中的调整P值都大于0.05时，可否使用p值<0.05+fc>2来筛选差异表达基因？

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问 如何判断一篇CHIPseq的文章用的是hg19还是hg38

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问 基因表达芯片的分类问题

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问 安捷伦（Agilent）的数据处理软件Feature Extraction Software的默认的数据标准化的算法是什么？最后得到的值是否做了log2处理？是否是RMA或者MASS的一种？

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问 请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？

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问 Affy包中的MAplot函数的作用是什么？画出的MAplot图如何解读？为何要进行MAplot检查？

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问 小麦660K芯片里，参考碱基那一列的A/C，哪个才是参考基因组的碱基？

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问 求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。

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问 芯片数据去除批次效应一般用什么软件 如何操作？

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问 芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

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