对突变组和对照组的某基因表达量做T检验

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根据GFF和fasta等文件提取某一基因的ATG位点信息，比如具体的位置？

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知道一批基因的具体位置，如何批量的从基因组中取出基因序列？

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关于 截取某基因前后200bp片段

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请问什么是基因组共线性分析？有什么意义？

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为什么差异基因分析会出现被KO的基因log2FC的数值大于1的情况

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差异可变剪接分析工具--rMATS-结果分析

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基因组组装

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如何提取比对上某一个基因或者某一段序列的所有reads

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请问一下，我的噬菌体基因组fasta文件还是config打头的，是不是需要进一步拼接成scaffold？还是挑选最大的config进行后续分析？

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问 请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？

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问 芯片数据去除批次效应一般用什么软件 如何操作？

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问 表达谱芯片的类型及每种类型能够测定的基因数量如何查询？有没有网站进行过总结？

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问 小麦660K芯片里，参考碱基那一列的A/C，哪个才是参考基因组的碱基？

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问 安捷伦（Agilent）的数据处理软件Feature Extraction Software的默认的数据标准化的算法是什么？最后得到的值是否做了log2处理？是否是RMA或者MASS的一种？

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问 基因表达芯片的分类问题

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问 当LIMMA计算计算结果中的调整P值都大于0.05时，可否使用p值<0.05+fc>2来筛选差异表达基因？

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问 使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

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问 关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件，为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别？

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问 如何判断一篇CHIPseq的文章用的是hg19还是hg38

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