转录本坐标转换成基因组坐标

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WGCNA筛选到感兴趣的模块后，如何找这个模块的hub基因呢？

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基因组文件中chrUn具体是什么意思呢

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基因表达芯片的分类问题

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关于tophat2 + cufflinks 得到的差异基因和featureCounts差异基因数目相差太大原因

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enhancer结合ATAC-seq进行下游靶基因的寻找策略

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请问一下，如何根据基因名批量下载CDS区的序列？

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一个cohort中，某基因count大于多少才有意义？

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细菌基因组分析

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两次运行同一个FQ文件产生的bam文件分析结果存在差异

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问 如何判断一篇CHIPseq的文章用的是hg19还是hg38

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问 小麦660K芯片里，参考碱基那一列的A/C，哪个才是参考基因组的碱基？

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问 Affy包中的MAplot函数的作用是什么？画出的MAplot图如何解读？为何要进行MAplot检查？

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问 芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

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问 关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件，为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别？

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问 安捷伦（Agilent）的数据处理软件Feature Extraction Software的默认的数据标准化的算法是什么？最后得到的值是否做了log2处理？是否是RMA或者MASS的一种？

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问 使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

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问 基因表达芯片的分类问题

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问 芯片数据去除批次效应一般用什么软件 如何操作？

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问 请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？

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