关于 截取某基因前后200bp片段

1498 浏览 3 关注 2 回答 0 评论

用log2(fold_change)数据做热图，遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为inf或-inf时，怎么办？

1594 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

基因表达芯片的分类问题

1564 浏览 3 关注 2 回答 0 评论

3D基因组里，如何分清compartment、TAD和chromatin loop

2231 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

菌侵染植物的转录组分析中，若菌的一个基因在当前时间没有引起植物基因的变化，过了三个小时后才引起植物基因的变化，如何分析这种现象或如何将这一类基因关联起来，有没有类似的文献推荐？

1311 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

二代测序中计算有多少个count数才有研究意义?

1518 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

R软件里Bray-Curtis指数计算

779 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

信号通路特征基因集的查询？用于作ssGSEA分析。

1354 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

ciriRNA表达量如何计算？（更）

1258 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

关于hub基因的问题

886 浏览 2 关注 0 回答 0 评论

问 如何判断一篇CHIPseq的文章用的是hg19还是hg38

1866 浏览 5 关注 3 回答 0 评论

问 安捷伦（Agilent）的数据处理软件Feature Extraction Software的默认的数据标准化的算法是什么？最后得到的值是否做了log2处理？是否是RMA或者MASS的一种？

807 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

问 表达谱芯片的类型及每种类型能够测定的基因数量如何查询？有没有网站进行过总结？

1120 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

1341 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 小麦660K芯片里，参考碱基那一列的A/C，哪个才是参考基因组的碱基？

1253 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

1286 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。

1205 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 基因表达芯片的分类问题

1564 浏览 3 关注 2 回答 0 评论

问 请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？

1809 浏览 2 关注 3 回答 0 评论

问 芯片数据去除批次效应一般用什么软件 如何操作？

1226 浏览 1 关注 1 回答 0 评论