首页
问答
文章
专栏
大咖
更多
话题
帮助
请输入关键字进行搜索
查看更多 "
" 的搜索结果
登录
全部分类
研究问题
单细胞相关
群体遗传相关
基因组组装
宏基因组分析
转录组分析
表观遗传学
其它研究问题
研究对象
人类
动物/模式动物
植物/模式植物
微生物
编程语言
Python
R语言
其它编程
测序技术
ChIP-seq
ATAC-seq
RNA-seq
基因组测序WGS/WES
Hi-C/HiChIP/ChIA-PET
单细胞测序
三代测序
其它技术
数学与算法
统计学相关
矩阵及线性代数
深度学习/机器学习
生信算法
生信入门
生信入门建议
经验分享
生信具体问题
吐槽话题专区
其它
资源分享
推荐
最新
热门
待回答
Kevin_Lyu
回复了问题
2018-08-25 15:30
R 多线程
问答
服务器上的Rstudio 怎样调用多线程并行运算
Kevin_Lyu
:
还没干过特意用R跑多线程的事儿呢,微软的 R open 是默认多线程的,而且运行速度比原始的R会快很多,了解一下?
赞同
2
反对
0 人感谢
0 评论
2 回复
孟浩巍
回复了问题
2018-08-25 13:05
生信入门
问答
亲问大家有没有chip-seq入门相关的教程?
孟浩巍
:
我觉得,ChIP-Seq最标准的流程,当然是跟着ENCODE的pipeline走咯! [url=https://www.encodeproject.org/pages/pipelines/#DNA-binding]ENCODE-ChIP-Seq处理pipeline[/url]
赞同
0
反对
0 人感谢
0 评论
5 回复
孟浩巍
回复了问题
2018-08-25 13:04
基因组注释
问答
为啥NCBI和ensemble相同版本的基因组注释有这么大的差别?
孟浩巍
:
因为两个组织注释的方法不同啊! 如果你都打开hg38,比较每一条染色体的长度和具体信息,都是完全一致的。 gene注释的话,NCBI应该是RefSeq + 部分预测, Ensembl是自己的Havana + 部分预测,方法和策略都不相同。数目的差异主要集中在lncRNA等非编码RNA的数量上。 所以...
赞同
0
反对
0 人感谢
0 评论
2 回复
孟浩巍
回复了问题
2018-08-25 13:01
RSutdio
问答
如何在Ubuntu 14.04 server版上安装Rstudio,并在网页上实现绘图功能?
孟浩巍
:
安装server版的Rstudio以后是通过网页访问和调用服务器资源的,可以直接画图,和本地几乎没有区别。
赞同
1
反对
0 人感谢
1 评论
3 回复
孟浩巍
回复了问题
2018-08-25 13:00
FASTQC
软件使用
问答
使用Trimmomatic切除接头后做FASTQC
孟浩巍
:
首先要明白什么是tile,tile是Illumina测序的时候,1条lane里面的1个小方格,而1个tile里面又有非常多的测序cluster。 这个提示的意思就是说你数据里的tile太多了,人家就不给你画每一个tile的质量分布图了。 仅此而已。
赞同
0
反对
0 人感谢
0 评论
1 回复
fcdslz
回复了问题
2018-08-25 01:21
Affy芯片
芯片数据分析
问答
关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件,为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别?
fcdslz
:
[attach]41[/attach] 终于找到了 原来是这么个玩法 那我都删了也行了
赞同
1
反对
0 人感谢
0 评论
2 回复
jailyn
回复了问题
2018-08-24 23:19
问题求解
R
heatmap
聚类分析
问答
用R画RNA_seq中变化显著的heatmap聚类热图
jailyn
:
ph = pheatmap(x,cluster_cols = F, cluster_rows = T, kmeans_k = 6) 用这个命令画出来成下边这个样子了 [attach]40[/attach]
赞同
0
反对
0 人感谢
1 评论
3 回复
孟浩巍
回复了问题
2018-08-24 23:15
电脑配置
问答
请教一个电脑配置的问题
孟浩巍
:
建议: 1. CPU最好是8代以后的i5或者是i7,如果是本地运行R的话,主频需要高一点,最好是3.5GHz以上; 2. 内存最少16GB; 3. 硬盘一定要SSD; 4. 系统,我个人推荐黑苹果,其次是windows,最后是裸奔Linux。 以上。
赞同
2
反对
0 人感谢
1 评论
3 回复
孟浩巍
回复了问题
2018-08-24 23:09
芯片数据分析
R
Affy芯片
质量控制
RNASeq数据处理
问答
Affy包中的MAplot函数的作用是什么?画出的MAplot图如何解读?为何要进行MAplot检查?
孟浩巍
:
MAplot是一个非常好的质控图,无论是在芯片数据分析中还是在RNA-Seq数据分析中都是经常使用的。 假设有ctrl和treat两组数据,gene K的表达量分别是 ctrl[K] 和 treat[K], MAplot的X轴就是每一个gene的几何平均数的log2值, M[K] = 0.5...
赞同
4
反对
1 人感谢
0 评论
1 回复
孟浩巍
回复了问题
2018-08-24 22:55
Cytoscape
生信分析
miRNA_mRNA互作分析
问答
测了实验组与对照组的mRNA与miRNA的转录组,miRNA-mRNA互作分析网络怎么处理呢?
孟浩巍
:
不知道你是什么物种,因为动物和植物的miRNA还是挺不一样的,这里我以动物的miRNA为例。 1. miRNA几乎都是1对多的调控,甚至出现1个对几百个gene的情况; 2. 一般动物里面常用targetScan的结果当做miRNA的靶标预测结果,里面有打分,打分的高低显示gene可能受miRN...
赞同
1
反对
0 人感谢
1 评论
2 回复
jailyn
回复了问题
2018-08-24 13:06
日常吐槽贴
问答
想说爱你不容易
jailyn
:
做完之后,感觉像十项全能
赞同
0
反对
0 人感谢
0 评论
1 回复
晨曦生辉耀匕尖
回复了问题
2018-08-24 12:17
建网页
问答
请问各位有什么好的建实验室主页的bootstrap等模板么
晨曦生辉耀匕尖
:
你可以去网上查一下v3bootstrap,里面有很多的模板随便挑,你试试能不能行
赞同
2
反对
0 人感谢
3 评论
1 回复
有你就足够
回复了问题
2018-08-24 11:26
没事找事
问答
墙裂建议公众号扩大点影响力
有你就足够
:
确实需要推荐,生信相关的网站比较少
赞同
0
反对
0 人感谢
0 评论
4 回复
i_thinking
回复了问题
2018-08-24 11:12
edgeR
批次效应
差异表达
问答
如何在差异表达前消除批次效应
i_thinking
:
可以试试deseq2
赞同
0
反对
0 人感谢
2 评论
1 回复
Eric
回复了问题
2018-08-24 10:33
生信入门
问答
seqtk的使用技巧,可以处理那些序列问题?
Eric
:
常用的例子都有 [url]https://github.com/lh3/seqtk[/url]
赞同
2
反对
0 人感谢
0 评论
1 回复
«
1
2
...
38
39
40
41
42
43
44
45
46
»
写回答
提问题
写文章
站点公告
做中国的BioStar——【生信坑】试运行公告
【生信坑】是一个完全免费的生物信息学交流、问答网站,目前我们正在进行试运营。 该网站的创办完全是为了给大家提供一个方便的问答交流平台,并且能够将精品的回答沉淀下来。 我们的目标是做非盈利、免费的问答网站, 最终的目标是: 做中国最好的生信问答网站! 在试运营阶段,如果发现网站有任何bug,...
热门话题
Agilent
讨论:
1
关注:
1
Google
讨论:
1
关注:
6
R数据处理
讨论:
1
关注:
2
可变剪切
讨论:
2
关注:
2
候选基因
讨论:
1
关注:
1
热门专栏
BioinfoNDD
文章:
4
浏览:
1847
渣渣入坑记录
文章:
0
浏览:
0
X Omics
文章:
0
浏览:
1
【生物坑】重要消息发布平台
文章:
0
浏览:
16
软件平台eGPS
文章:
0
浏览:
0
热门用户
宋亚丹
提问:
0
获赞:
3
pagu
提问:
0
获赞:
9
wuyukang
提问:
0
获赞:
2
刘上
提问:
0
获赞:
2
ZYX
提问:
4
获赞:
2
All Rights Reserved Powered BY
WeCenter V4.1.0
© 2024
关于我们
社区规范
你的浏览器版本过低,可能导致网站部分内容不能正常使用!
为了能正常使用网站功能,请使用以下浏览器
Chrome
Firefox
Safari
IE 10+