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孟浩巍 回复了问题 2023-05-23 21:38 问题求解: 问答科研/读博

孟浩巍: 这是一个很大的问题，要展开谈，肯定又是几千字。在这里我只能说尽量，凡事都要尽量，尽自己最大的所能。我们绝大多数人还到不了拼天赋的时候。最后，就是培养自己idea落地的能力，是一个漫长的过程，但是第一步就是读文献，要阅读大量的文献。你这个领域的200篇最经典的文献先读完，再说。; 赞同2 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

孟浩巍 回复了问题 2023-05-23 09:39 问题求解 生信问题 生信具体问题: 问答使用tophat2和bowtie1寻找环形RNA时报错

孟浩巍: 目前只看报错不能判断问题。 chatGPT的回答有一定的参考性，我有几方面的建议。 1. 考虑是不是index有问题，就是用测试数据是否能跑通？ 2. 是不是能复现这个问题，就是每次运行都报这个错误，能否定位到具体是哪个reads引发的报错？能复现错误，之后才好进一步排查。; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

阿斯---- 回复了问题 2023-05-17 17:35 问题求解: 问答分析CRISPR 高通量筛选数据

阿斯----: 当我选择输出文件的位置时，浏览器的页面会变成灰色，同时RSTUDIO会报错。报错内容如下: Listening on http://127.0.0.1:4752 Warning: Error in ||: ...; 赞同1 反对 0 人感谢 2 评论 2 回复

俄二十 回复了问题 2018-09-28 22:27 问题求解 GATK: 问答利用GATK的HaplotypeCaller生成GVCF一直报错怎么回事

俄二十: 加了还是不行，这次貌似是另外一种错误; 赞同0 反对 0 人感谢 2 评论 2 回复

海王坑 回复了问题 2018-09-10 10:58 问题求解: 问答 linux系统中使用fastqc报错

海王坑: [url]https://zhuanlan.zhihu.com/p/35711429参考这个[/url]; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 3 回复

windowft 回复了问题 2018-09-09 22:07 问题求解: 问答 bowtie2使用报错，求助啦

windowft: 谢谢大家，更换了内存条之后，就可以运行了，确实是电脑的内存不足; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 3 回复

minipeach 回复了问题 2018-09-01 14:03 问题求解 heatmap: 问答画heatmap出现错误提示

minipeach: 你数据中有缺失值？; 赞同0 反对 0 人感谢 1 评论 1 回复

孟浩巍 回复了问题 2018-08-30 20:25 问题求解: 问答如何快速将基因名称转换为基因ID(拟南芥）

孟浩巍: 可以参考我的代码，使用org里面拟南芥的数据库 [code]############################################# # 第1次运行请安装下列R包 ############################################# source("htt...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

jailyn 回复了问题 2018-08-24 23:19 问题求解 R heatmap 聚类分析: 问答用R画RNA_seq中变化显著的heatmap聚类热图

jailyn: ph = pheatmap(x,cluster_cols = F, cluster_rows = T, kmeans_k = 6) 用这个命令画出来成下边这个样子了 [attach]40[/attach]; 赞同0 反对 0 人感谢 1 评论 3 回复

米婷婷 回复了问题 2018-08-23 20:59 问题求解: 问答如何处理fastqc报告中duplication level报错的问题

米婷婷: [size=14]fastx_trimmer是为了去掉测序质量不好的两端序列并且统一所有reads的长度，所以只能按照你最终要求的长度来切而不可能去补平，根据fastqc的结果看首尾两端质量较差的片段有多长再决定 -f 和 -l 参数，比如说我的测序长度是150bp, cutadapt 去除完低于1...; 赞同3 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

孟浩巍 回复了问题 2018-08-23 17:21 问题求解 FASTQC: 问答使用cutadapt去掉adaptor后，fastqc结果的sequence distribution报错

孟浩巍: 是这样，因为每个reads真正测出来的adapter的长度是不同的，因此去掉adapter以后剩下的序列长度也就不同了。 FastQC这个软件，当你的reads长度范围超过一定的时候都会报错，问题不大。如果想要弄成长度一样的序列，可以考虑使用[size=14]fastx_trimmer 或者是...; 赞同3 反对 0 人感谢 2 评论 2 回复

jailyn 回复了问题 2018-08-23 14:47 问题求解 GO分析 R: 问答 R进行GO时出现No gene can be mapped....

jailyn: 修改成为“ENTREZID” 之后还是一样的问题。 --> No gene can be mapped.... --> Expected input gene ID: 818055,837839,839140,831727,832825,839243 --> return NULL...; 赞同1 反对 0 人感谢 4 评论 3 回复

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