首页
问答
文章
专栏
大咖
更多
话题
帮助
请输入关键字进行搜索
查看更多 "
" 的搜索结果
登录
测了实验组与对照组的mRNA与miRNA的转录组,miRNA-mRNA互作分析网络怎么处理呢?
关注问题
回答问题
该问题已被锁定!
2
关注
964
浏览
测了实验组与对照组的mRNA与miRNA的转录组,miRNA-mRNA互作分析网络怎么处理呢?
Cytoscape
生信分析
miRNA_mRNA互作分析
差异miRNA 几十个, 差异mRNA 有3000多个? 现在思路:1 . miRNA靶基因预测 与实际测序有差异的mRNA取交集, 然后找出miRNA-mRNA调控对,但是这个Cytoscape做出来节点有600多个,图根本就看不出来有什么意义。 各位大神是否有类似的分析思路给点建议? 或者有miRNA-mRNA互作分析的建议呢? 蟹蟹~~
阅读全文
收起全文
关注问题
回答问题
邀请回答
好问题
0
评论
收藏
举报
分享
复制链接
新浪微博
腾讯空间
微信扫一扫
展开
收起
0
评论
为什么被折叠?
0 个回复被折叠
2
回答
热门排序
最新排序
热门排序
只看楼主
孟浩巍
超级管理员
用户来自于: 北京市
2018-08-24 22:55
不知道你是什么物种,因为动物和植物的miRNA还是挺不一样的,这里我以动物的miRNA为例。 1. miRNA几乎都是1对多的调控,甚至出现1个对几百个gene的情况; 2. 一般动物里面常用targetScan的结果当做miRNA的靶标预测结果,里面有打分,打分的高低显示gene可能受miRNA调控的保守程度。一般认为,1个miRNA对1个gene的分数越高,越可能调控这个gene。 因此,我建议,你可以选择打分比较高的,比如top10的gene去做下游的挖掘,是不是更有可能?
阅读全文
收起全文
赞同
1
1
评论
分享
复制链接
新浪微博
腾讯空间
微信扫一扫
1
评论
海王坑
前台管理员
用户来自于: 湖北省武汉市
2018-08-24 21:51
这个还是得基于具体的生物学意义去分析互作网络,去看别人文献吧
阅读全文
收起全文
赞同
0
1
评论
分享
复制链接
新浪微博
腾讯空间
微信扫一扫
1
评论
关于作者
桶桶要好好学习
初级会员
这家伙很懒,还没有设置简介
1
回答
0
文章
4
问题
问题动态
发布时间
2018-08-24 16:16
更新时间
2018-08-24 22:55
关注人数
2 人关注
相关问题
H3K27ac occupancy怎么定义?
1072 浏览
2 关注
2 回答
0 评论
RNA-seq不同样本多个生物学重复不同处理条件下的如何找差异基因
873 浏览
2 关注
2 回答
0 评论
oh my zsh怎么配置
487 浏览
1 关注
0 回答
0 评论
R语言安装"Rhtslib"软件包,出现如下报错怎么办?
1299 浏览
2 关注
2 回答
0 评论
bioPython1.72版本怎么安装,我在Python子文件夹里找到Bio和bioPython1.72.dist-info,可在Python界面就是导不入,有没有大神解答一下
852 浏览
0 关注
0 回答
0 评论
求助一个shell脚本问题,如何批量处理下面这种情况?
803 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
生信问题(我也不知道该怎么问)
1515 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
R语言安装"MotIV"软件包,出现如下报错怎么办?
775 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
【求助】怎么能画出子网络图
599 浏览
1 关注
0 回答
0 评论
Rstudio怎么打开project
1034 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
推荐内容
问
GWAS和WGS的选择消除分析有什么区别呀?
759 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
关于Cytoscape插件ClueGO的问题
848 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
关于ceRNA网络构建的后续分析有哪些?
696 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
ATAC-seq绘制TSS富集图
1433 浏览
2 关注
2 回答
2 评论
问
请问cytoscape是怎么构建网络的?
798 浏览
3 关注
1 回答
0 评论
问
ChIP-seq的bigwig文件可以使用rpkm>1过滤掉一些弱的信号吗?
1135 浏览
2 关注
2 回答
0 评论
问
关于基因间的相关性分析
1022 浏览
2 关注
2 回答
0 评论
问
Bowtie2使用中遇到的内存不足问题
888 浏览
1 关注
2 回答
0 评论
问
纤维二糖功能
1332 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
ATAC-seq不同测序量样本的差异比较
1016 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
All Rights Reserved Powered BY
WeCenter V4.1.0
© 2024
关于我们
社区规范
你的浏览器版本过低,可能导致网站部分内容不能正常使用!
为了能正常使用网站功能,请使用以下浏览器
Chrome
Firefox
Safari
IE 10+