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测了实验组与对照组的mRNA与miRNA的转录组,miRNA-mRNA互作分析网络怎么处理呢?

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孟浩巍 超级管理员 用户来自于: 北京市
2018-08-24 22:55
不知道你是什么物种,因为动物和植物的miRNA还是挺不一样的,这里我以动物的miRNA为例。   1. miRNA几乎都是1对多的调控,甚至出现1个对几百个gene的情况; 2. 一般动物里面常用targetScan的结果当做miRNA的靶标预测结果,里面有打分,打分的高低显示gene可能受miRNA调控的保守程度。一般认为,1个miRNA对1个gene的分数越高,越可能调控这个gene。   因此,我建议,你可以选择打分比较高的,比如top10的gene去做下游的挖掘,是不是更有可能?
海王坑 前台管理员 用户来自于: 湖北省武汉市
2018-08-24 21:51
这个还是得基于具体的生物学意义去分析互作网络,去看别人文献吧

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发布时间
2018-08-24 16:16
更新时间
2018-08-24 22:55
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