首页
问答
文章
专栏
大咖
更多
话题
帮助
请输入关键字进行搜索
查看更多 "
" 的搜索结果
登录
请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法?
关注问题
回答问题
该问题已被锁定!
2
关注
2603
浏览
请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法?
芯片数据分析
比如 affy芯片 一般用什么工具包 分几步处理 每一步的算法一般怎么选用,最好再分享下常遇到的问题。
阅读全文
收起全文
关注问题
回答问题
邀请回答
好问题
0
评论
收藏
举报
分享
复制链接
新浪微博
腾讯空间
微信扫一扫
展开
收起
0
评论
查看全部
3
个回答
孟浩巍
超级管理员
用户来自于: 北京市
2018-08-23 14:45
芯片数据分析,大概可以分成这么几个步骤: [attach]10[/attach] 分别是背景矫正(background correction) -> 归一化(normalization) -> 合并探针 (summarization) 每一步的算法最常用的如下: [attach]11[/attach]
阅读全文
收起全文
赞同
1
0
评论
分享
复制链接
新浪微博
腾讯空间
微信扫一扫
0
评论
关于作者
fcdslz
超级管理员
这家伙很懒,还没有设置简介
13
回答
1
文章
12
问题
问题动态
发布时间
2018-08-23 13:57
更新时间
2018-08-23 15:49
关注人数
2 人关注
相关问题
请问一下,如何将登陆服务器局域网的ip设置为静态的呢?
1575 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
奇异值分解在处理芯片数据时的意义是什么?
1365 浏览
1 关注
0 回答
0 评论
进行转录组数据分析时,进行cuffdiff后的输出文件gene_exp.diff中,一个基因出现了两个不同的表达量数据,应该如何处理?
1755 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
请问一下,使用conda install deeptools之后,出现如下报错,如何解决呢?
2519 浏览
1 关注
1 回答
0 评论
我想从蠕虫库寄生虫 (wormbase.org)上下载全部的fa文件,请问怎么样才能批量的下载,同时下载的速度可以稍微快一点
2776 浏览
2 关注
3 回答
0 评论
chipseq中一共一般有多少峰,可以认为实验是比较靠谱的呢
2574 浏览
2 关注
2 回答
0 评论
关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件,为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别?
2698 浏览
2 关注
2 回答
0 评论
请问一下,如何根据基因名批量下载CDS区的序列?
2223 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
用GWAS筛选受选择基因,样本数量不够,请问可以用选择消除分析吗
1949 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
请问什么是基因组共线性分析?有什么意义?
1342 浏览
1 关注
0 回答
1 评论
推荐内容
问
安捷伦(Agilent)的数据处理软件Feature Extraction Software的默认的数据标准化的算法是什么?最后得到的值是否做了log2处理?是否是RMA或者MASS的一种?
1169 浏览
1 关注
0 回答
0 评论
问
芯片数据去除批次效应一般用什么软件 如何操作?
1732 浏览
1 关注
1 回答
0 评论
问
求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。
1745 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大?
1854 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
如何判断一篇CHIPseq的文章用的是hg19还是hg38
2720 浏览
5 关注
3 回答
0 评论
问
表达谱芯片的类型及每种类型能够测定的基因数量如何查询?有没有网站进行过总结?
1652 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
小麦660K芯片里,参考碱基那一列的A/C,哪个才是参考基因组的碱基?
1775 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
当LIMMA计算计算结果中的调整P值都大于0.05时,可否使用p值<0.05+fc>2来筛选差异表达基因?
2501 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
在很多分析表达谱芯片的教程中,使用limma 包寻找差异表达基因,都是先找到差异表达探针,再把探针注释为基因id,为何不先进行注释再计算差异表达呢?这两种方法有什么区别呢?
1908 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
使用MAS5.0处理过的芯片数据,能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因,为什么不能?
2089 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
All Rights Reserved Powered BY
WeCenter V4.1.0
© 2025
关于我们
社区规范
你的浏览器版本过低,可能导致网站部分内容不能正常使用!
为了能正常使用网站功能,请使用以下浏览器
Chrome
Firefox
Safari
IE 10+