如何提取比对上某一个基因或者某一段序列的所有reads

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SOAPdenovo-Trans 组装的 contig 如何获得 gene_trans_map

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问题：如何筛选WGCNA分析得出的consensus module中的hub基因？

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请问有谁知道这张图是如何绘制的吗，在NCBI的Conserved Domians模块没找到可以直接导出的地方

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如何获得cas9蛋白的高效低效的sgRNA

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GAPIT包导出的GWAS结果如何添加新的阈值线？以及GAPIT的结果文件中的nobs、H&B.P.Value、Effect分别是什么意思？

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用scanpy做单细胞分析，如何去除周期细胞的影响

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如何使用seqtk按照比例随机提取单细胞数据？

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Affy包中的MAplot函数的作用是什么？画出的MAplot图如何解读？为何要进行MAplot检查？

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如何方便快捷地批量重命名qiime2做出的ASV号？

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问 关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件，为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别？

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问 求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。

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问 使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

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问 表达谱芯片的类型及每种类型能够测定的基因数量如何查询？有没有网站进行过总结？

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问 芯片数据去除批次效应一般用什么软件 如何操作？

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问 安捷伦（Agilent）的数据处理软件Feature Extraction Software的默认的数据标准化的算法是什么？最后得到的值是否做了log2处理？是否是RMA或者MASS的一种？

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问 当LIMMA计算计算结果中的调整P值都大于0.05时，可否使用p值<0.05+fc>2来筛选差异表达基因？

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问 Affy包中的MAplot函数的作用是什么？画出的MAplot图如何解读？为何要进行MAplot检查？

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问 芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

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问 基因表达芯片的分类问题

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