IOBR包输入基因表达矩阵要求

756 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

有关蛋白表达定量的数据库数据打包下载(蛋白组学)

773 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

关于拟南芥着色粒附近的变异数量

967 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

3D基因组里compartment里一般是包含好多TAD的，但这图为什么compartment数量比TAD多这么多呢

899 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

绵羊转录组测序后差异表达基因太多了

1261 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

GTEx项目的数据类型

767 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

869 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

基因表达芯片的分类问题

994 浏览 3 关注 2 回答 0 评论

多种DL based的label transfer自动注释细胞类型,降维clustering两者不太匹配. 如何进行下一步的paga analysis呢?

937 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

如何针对affy表达谱芯片计算结果分析不同样本之间是否表达差异

682 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 芯片数据去除批次效应一般用什么软件 如何操作？

819 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

问 芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

812 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 基因表达芯片的分类问题

994 浏览 3 关注 2 回答 0 评论

问 安捷伦（Agilent）的数据处理软件Feature Extraction Software的默认的数据标准化的算法是什么？最后得到的值是否做了log2处理？是否是RMA或者MASS的一种？

513 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

问 请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？

1157 浏览 2 关注 3 回答 0 评论

问 如何判断一篇CHIPseq的文章用的是hg19还是hg38

1155 浏览 5 关注 3 回答 0 评论

问 在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

899 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 Affy包中的MAplot函数的作用是什么？画出的MAplot图如何解读？为何要进行MAplot检查？

1052 浏览 3 关注 1 回答 0 评论

问 关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件，为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别？

1071 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问 求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。

694 浏览 2 关注 1 回答 0 评论