【求助】如何确定时期特定表达基因

1246 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

【求助】差异表达和特异表达

1730 浏览 3 关注 2 回答 0 评论

在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

1410 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

log2(fold_change)可以用来做热图吗？遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为0时，怎么办？

1763 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

如何针对affy表达谱芯片计算结果分析不同样本之间是否表达差异

1142 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

用log2(fold_change)数据做热图，遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为inf或-inf时，怎么办？

1668 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

如何理解单细胞测序中用fastQC对低质量细胞进行过滤

1782 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

进行转录组数据分析时，进行cuffdiff后的输出文件gene_exp.diff中，一个基因出现了两个不同的表达量数据，应该如何处理？

1225 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

多种DL based的label transfer自动注释细胞类型,降维clustering两者不太匹配. 如何进行下一步的paga analysis呢?

1707 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

如何在差异表达前消除批次效应

1483 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

1410 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

1368 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 基因表达芯片的分类问题

1623 浏览 3 关注 2 回答 0 评论

问 使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

1516 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。

1257 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 安捷伦（Agilent）的数据处理软件Feature Extraction Software的默认的数据标准化的算法是什么？最后得到的值是否做了log2处理？是否是RMA或者MASS的一种？

841 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

问 当LIMMA计算计算结果中的调整P值都大于0.05时，可否使用p值<0.05+fc>2来筛选差异表达基因？

1882 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 Affy包中的MAplot函数的作用是什么？画出的MAplot图如何解读？为何要进行MAplot检查？

1798 浏览 3 关注 1 回答 0 评论

问 如何判断一篇CHIPseq的文章用的是hg19还是hg38

1935 浏览 5 关注 3 回答 0 评论

问 请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？

1892 浏览 2 关注 3 回答 0 评论