关于 截取某基因前后200bp片段

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关于基因间的相关性分析

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几个酶有许多共同基因，这些酶产物之间存在什么关系

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基因本体论分析上下调基因差异

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菌侵染植物的转录组分析中，若菌的一个基因在当前时间没有引起植物基因的变化，过了三个小时后才引起植物基因的变化，如何分析这种现象或如何将这一类基因关联起来，有没有类似的文献推荐？

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细菌基因组分析

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使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

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问题：如何筛选WGCNA分析得出的consensus module中的hub基因？

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在仅有每个样本(有3个repeat)所有转录本的fpkm的情况下，如何利用cuffdiff进行差异基因分析。

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根据GFF和fasta等文件提取某一基因的ATG位点信息，比如具体的位置？

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