关于基因对某种疾病的影响的问题

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seurat包，如何调节大热图左侧的基因字体大小

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根据已知序列查找其第三代基因组编号

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可否用sanger测序测某一基因的上下游序列

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信号通路特征基因集的查询？用于作ssGSEA分析。

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ATAC-seq不同测序量样本的差异比较

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log2(fold_change)可以用来做热图吗？遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为0时，怎么办？

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验证数据集基因名称

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一个cohort中，某基因count大于多少才有意义？

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FPKM计算问题

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问 如何判断一篇CHIPseq的文章用的是hg19还是hg38

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问 请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？

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问 求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。

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问 关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件，为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别？

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问 基因表达芯片的分类问题

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问 使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

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问 在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

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问 安捷伦（Agilent）的数据处理软件Feature Extraction Software的默认的数据标准化的算法是什么？最后得到的值是否做了log2处理？是否是RMA或者MASS的一种？

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问 表达谱芯片的类型及每种类型能够测定的基因数量如何查询？有没有网站进行过总结？

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问 小麦660K芯片里，参考碱基那一列的A/C，哪个才是参考基因组的碱基？

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