芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

1120 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

为啥NCBI和ensemble相同版本的基因组注释有这么大的差别？

1531 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

关于hub基因的问题

828 浏览 2 关注 0 回答 0 评论

如何按一个列表对基因型文件进行过滤，剔除不需要的样本？

1429 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

ciriRNA表达量如何计算？

1562 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

用GWAS筛选受选择基因，样本数量不够，请问可以用选择消除分析吗

1144 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

riboseq中frame指的是什么，是如何确定的，通过riboseq如何知道一个基因的开放阅读框

1270 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

宏基因组进行binning分析

2048 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

如果在基因组中鉴定到病毒序列，如何从生信角度判断它是EVEs还是HGTs

1081 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

如何针对affy表达谱芯片计算结果分析不同样本之间是否表达差异

967 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件，为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别？

1625 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问 使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

1327 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 表达谱芯片的类型及每种类型能够测定的基因数量如何查询？有没有网站进行过总结？

1032 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

1182 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 如何判断一篇CHIPseq的文章用的是hg19还是hg38

1713 浏览 5 关注 3 回答 0 评论

问 基因表达芯片的分类问题

1431 浏览 3 关注 2 回答 0 评论

问 Affy包中的MAplot函数的作用是什么？画出的MAplot图如何解读？为何要进行MAplot检查？

1587 浏览 3 关注 1 回答 0 评论

问 芯片数据去除批次效应一般用什么软件 如何操作？

1131 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

问 芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

1120 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。

1086 浏览 2 关注 1 回答 0 评论