如果在基因组中鉴定到病毒序列，如何从生信角度判断它是EVEs还是HGTs

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bivalent domains 如何计算

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FPKM计算问题

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根据GFF和fasta等文件提取某一基因的ATG位点信息，比如具体的位置？

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【求助】如何确定时期特定表达基因

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基因表达

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3D基因组里compartment里一般是包含好多TAD的，但这图为什么compartment数量比TAD多这么多呢

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验证数据集基因名称

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全基因组关联分析结果与模型选择

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转录本坐标转换成基因组坐标

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问 小麦660K芯片里，参考碱基那一列的A/C，哪个才是参考基因组的碱基？

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问 安捷伦（Agilent）的数据处理软件Feature Extraction Software的默认的数据标准化的算法是什么？最后得到的值是否做了log2处理？是否是RMA或者MASS的一种？

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问 如何判断一篇CHIPseq的文章用的是hg19还是hg38

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问 芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

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问 芯片数据去除批次效应一般用什么软件 如何操作？

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问 关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件，为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别？

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问 请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？

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问 基因表达芯片的分类问题

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问 表达谱芯片的类型及每种类型能够测定的基因数量如何查询？有没有网站进行过总结？

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问 求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。

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