3D基因组里compartment里一般是包含好多TAD的，但这图为什么compartment数量比TAD多这么多呢

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基因组组装问题

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第二代测序碱基出错偏向的原因是什么 为什么第二代测序碱基出错主要以替换为主 稀有碱基会影响测序吗

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宏基因组进行binning分析

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如何根据现有序列找到它们在三代基因组的编号

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宏基因组注释率超低

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在riboseq分析中，如何对没有起始密码子和终止密码子的转录本进行三碱基准确性分析？

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耐药细菌的比较基因组分析流程和机制探索

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EVM整合基因组注释

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请问一下，我的噬菌体基因组fasta文件还是config打头的，是不是需要进一步拼接成scaffold？还是挑选最大的config进行后续分析？

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问 当LIMMA计算计算结果中的调整P值都大于0.05时，可否使用p值<0.05+fc>2来筛选差异表达基因？

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问 求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。

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问 基因表达芯片的分类问题

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问 请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？

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问 如何判断一篇CHIPseq的文章用的是hg19还是hg38

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问 芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

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问 芯片数据去除批次效应一般用什么软件 如何操作？

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问 关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件，为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别？

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问 使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

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问 Affy包中的MAplot函数的作用是什么？画出的MAplot图如何解读？为何要进行MAplot检查？

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