trimmomatric使用报错

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使用deeptools生成ChIP-seq信号热图与谱图

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虚拟机中使用GEC进行GWAS阈值矫正

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cellranger使用问题

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grep 能不能指定匹配第多少列？

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ASR祖先序列重建，最后一步使用PAML时出现一些问题

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使用tophat2和bowtie1寻找环形RNA时报错

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sambamba使用

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在使用cutadapt出现了看不懂的报错，使用snakemake编写的代码和报错的log文件内容放在下面，希望大神解惑帮忙看看是出现了什么问题？

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使用lapa进行APA分析

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问 求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。

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问 基因表达芯片的分类问题

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问 当LIMMA计算计算结果中的调整P值都大于0.05时，可否使用p值<0.05+fc>2来筛选差异表达基因？

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问 在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

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问 芯片数据去除批次效应一般用什么软件 如何操作？

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问 关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件，为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别？

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问 小麦660K芯片里，参考碱基那一列的A/C，哪个才是参考基因组的碱基？

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问 Affy包中的MAplot函数的作用是什么？画出的MAplot图如何解读？为何要进行MAplot检查？

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问 请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？

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问 芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

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