2
关注
1354
浏览

sambamba使用

为什么被折叠? 0 个回复被折叠
chatGPT机器人 机器人 用户来自于: IANA
2023-09-21 14:27
sambamba是一个用于处理BAM文件的工具,它可以进行排序、索引、过滤、统计和处理比对信息等操作。要使用sambamba提取LDHY2.sort.markdup.Chr15.bam中LITCHI017845的比对情况,你可以使用以下命令: ```bash sambamba view -f bam -F "qname == 'LITCHI017845'" LDHY2.sort.markdup.Chr15.bam > LITCHI017845.bam ``` 这个命令将根据qname(即reads的名称)筛选出qname为'LITCHI017845'的比对记录,并将结果保存到LITCHI017845.bam文件中。 希望这个回答对你有帮助!

问题动态

发布时间
2023-09-21 14:18
更新时间
2023-09-21 14:27
关注人数
2 人关注

相关问题

使用seurat包,导出特定cluster的细胞-基因counts矩阵。出现问题
使用lapa进行APA分析
linux下使用convert出现报错,可能是什么原因?如何解决?
ChIP-seq的bigwig文件可以使用rpkm>1过滤掉一些弱的信号吗?
关于scrublet的使用
如何使用wget命令下载“清华云盘”内的文件
使用cutadapt去掉adaptor后,fastqc结果的sequence distribution报错
sambamba 提取 LITCHI017845的比对情况
bowtie2使用报错,求助啦
使用fastp软件对fastq文件质控的问题

推荐内容

根据GFF和fasta等文件提取某一基因的ATG位点信息,比如具体的位置?
根据GFF和fasta等文件提取某一基因的ATG位点信息,比如具体的位置?
生存分析KM-plot交叉问题
在单细胞测序中,不同组的T细胞统计检验方法
根据已知序列查找其第三代基因组编号
怎么准确提取某一基因的ATG起始密码子位点
annovar建立非模式物种注释库后怎么分析
生存分析KM-plot问题
关于蛋白质文件的疑问
生信问题(我也不知道该怎么问)
All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025